灵活就业人员缴纳社保时显示为企业，可能是因为灵活就业人员选择的参保方式是以个人身份参加企业职工基本养老保险。这种参保方式允许无雇工的个体工商户、未在用人单位参加基本养老保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员根据自身情况，自愿选择参加企业职工基本养老保险。虽然这种参保方式的缴费由个人承担，但参保人员享受的是与企业职工相同的养老待遇计发方式。

具体来说，灵活就业人员在参保时，可以选择在本省全口径城镇单位就业人员平均工资的60%~300%之间确定缴费基数，缴费比例为20%。参保人员可以按月、按季、按半年、按年等方式缴费，并且可以在就业地或户籍地参加企业职工基本养老保险，不受户籍限制。

因此，当灵活就业人员缴纳社保时，虽然显示为企业，但实际上这是以个人身份参加的企业职工基本养老保险，与企业职工的社保制度是相同的，只是缴费方式和比例有所不同。这种参保方式旨在保障灵活就业人员的养老权益，确保他们在达到法定退休年龄后能够享受到相应的养老金待遇。