工厂搬迁时，关于如何赔偿员工工资的问题，主要遵循以下原则和建议：
一、赔偿原则
经济补偿依据：
- 当工厂搬迁导致劳动合同无法履行，且双方未能就变更劳动合同内容达成一致时，工厂需向员工支付经济补偿。
- 经济补偿的金额依据员工在本单位的工作年限来确定，具体为：每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资。
- 这里所指的“月工资”是劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
解除劳动合同的方式：
- 工厂可以选择提前三十日以书面形式通知员工，或者额外支付员工一个月工资后解除劳动合同。
二、特殊情况处理
员工拒绝随迁：
- 若搬迁致使劳动合同订立时的客观情况发生重大变化（如工作地点变动过大影响员工正常生活），且双方未能就变更劳动合同内容达成一致，工厂在提前通知或额外支付一个月工资后，可以解除劳动合同，并需支付经济补偿。
- 若搬迁未对劳动合同履行造成实质影响，员工无正当理由拒绝随迁并自行离职，工厂则无需支付经济补偿。
额外诉求：
- 在某些情况下，如员工因工厂搬迁导致通勤距离大幅增加，产生了额外的交通费用等，可以与工厂协商寻求合理补偿。
- 若工厂搬迁使得员工原有的工作环境和条件发生较大改变（如工作场所的设施设备不如之前），员工也有权提出相应诉求。
三、建议与注意事项
充分协商：
- 工厂在搬迁前应与员工进行充分协商，尽量就劳动合同变更达成一致，以避免经济补偿的纠纷。
依法依规：
- 工厂在搬迁过程中应遵守相关法律法规，确保员工的合法权益得到保障。
积极维权：
- 员工应积极主动维护自身权益，及时与工厂沟通协商补偿事宜。若协商无果，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁维权。
留存证据：
- 员工在维权过程中应留存相关证据（如劳动合同、工资单、搬迁通知等），以便在需要时提供证明。
综上所述，工厂搬迁时如何赔偿员工工资是一个涉及多方面因素的问题。工厂应遵循相关法律法规，与员工进行充分协商，并依法支付经济补偿。员工也应积极主动维护自身权益，及时留存相关证据，并在必要时寻求法律帮助。