单位长期放假只发基本工资，在一定条件下是合法的，但具体需结合法律规定、劳动合同约定及企业规章制度综合判断。
一、合法性分析
法定节假日与休息日：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十一条，法定节假日是带薪休假日，员工应获得正常工资。若公司在法定节假日安排放假且仅支付基本工资（且该基本工资不低于当地最低工资标准），这通常是合法的。
- 休息日（如周末）本身无需支付工资，但若公司因生产经营需要调整工作安排，并与员工协商或依法支付加班费，则也符合法律规定。
停工停产期间：
- 根据《工资支付暂行规定》第十二条，非因劳动者原因造成单位停工、停产超过一个工资支付周期的，用人单位可按当地规定支付生活费或基本工资。这意味着，在某些特定情况下（如疫情期间的停工），公司仅发放基本工资是合法的。
劳动合同与企业制度：
- 若劳动合同或企业规章制度中明确约定了放假期间的工资标准，并且该标准不低于当地最低工资标准，那么公司按照此约定发放基本工资也是合法的。
二、不合法情形
无故克扣工资：
- 如果公司没有合理理由（如经营困难、不可抗力等）而单方面降低工资标准，这可能违反了《劳动合同法》第三十条关于按时足额支付劳动报酬的规定。
低于最低工资标准：
- 基本工资不得低于当地最低工资标准。如果公司发放的基本工资低于这一标准，即使标注为“基本工资”，也是违法的。
未履行协商程序：
- 涉及工资调整的重大事项，公司应与工会或职工代表进行协商。如果公司未经协商就单方面决定降低工资，这样的决定可能被认定为无效。
三、建议措施
核查合同条款：
- 员工应仔细查看劳动合同中关于工资支付的条款，以及企业规章制度的合法性，确保自己的权益不受侵害。
沟通协商：
- 如果对公司放假期间的工资支付有疑问或不满，建议通过工会或直接与公司人力资源部门进行沟通，了解放假的具体原因和工资计算依据。
法律救济：
- 如果认为自己的权益受到了侵害，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。根据《劳动争议调解仲裁法》，此类争议可以在一年内提出。
综上所述，单位长期放假只发基本工资的合法性取决于具体情况。员工应仔细核查劳动合同、企业规章制度以及相关法律法规，以确保自己的权益得到妥善保护。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。