您好，关于乡镇助理医师是否可以注册在诊所的问题，我根据相关政策法规为您详细解答如下：

首先，根据《医师资格考试报名资格规定(2014版)》的相关规定，2011年1月1日以后入学的中等中医类专业毕业生，在考取助理医师后，其执业地点是有限制的。具体来说，这类助理医师不能注册到诊所，但可以注册到乡镇卫生院、村卫生室以及社区服务中心、社区服务站等基层医疗机构。

其次，从助理医师的执业权限来看，根据医师法第三十四条的规定，执业助理医师通常需要在执业医师的指导下进行执业活动。然而，在乡、民族乡、镇和村的医疗卫生机构，以及艰苦边远地区的县级医疗卫生机构中，执业助理医师可以根据医疗卫生服务情况和本人实践经验，独立从事一般的执业活动。但这一规定并不等同于助理医师可以开设诊所或随意选择执业地点。

最后，关于助理医师是否可以开诊所的问题，根据国家卫健委、国家中医药管理局发布的《诊所备案管理暂行办法》和《诊所基本标准2022》的相关规定，个人设置诊所的，必须经注册后在医疗卫生机构中执业满五年，并且这一要求是针对执业医师的，助理医师并不具备开设诊所的资格。

综上所述，乡镇助理医师不能注册在诊所，其执业地点和权限受到相关政策法规的严格限制。如果您有进一步的疑问或需要更详细的解答，请随时咨询相关部门或专业机构。