关于诊所法人的药师证能否注册在自己的诊所这一问题，首先我们需要明确的是，执业药师证是可以注册在其本人作为法人的诊所的，但前提是该执业药师必须实际在岗履职。

这里涉及到一个关键概念，即“挂证”行为。根据奉节县市场监督管理局关于药品经营企业执业药师“挂证”问题的告知书，我们可以了解到，“挂证”是指执业药师本人不在岗履职，仅将《执业药师注册证》挂靠在药品经营企业，以满足企业执业药师配备要求的违规行为。这种行为是严格被禁止的，因为它会影响药品质量安全，破坏市场公平竞争，并可能引发一系列法律责任。

对于诊所而言，如果其法人拥有执业药师证，并且该法人确实在诊所内实际从事药品经营质量管理工作，包括药品质量管理、处方审核等，那么其药师证是可以注册在该诊所的。这种注册是合法的，也是符合药品经营质量管理规范的。

然而，如果诊所法人仅仅是将药师证挂靠在诊所，而本人并不实际在岗履职，那么这就构成了“挂证”行为，是违法的，并可能面临严重的法律后果，包括撤销执业药师注册证、罚款、甚至吊销药品经营许可证等。

因此，我建议您，如果诊所法人拥有执业药师证，并希望将其注册在诊所，那么必须确保该法人实际在岗履职，严格遵守药品经营质量管理规范，以保障公众用药安全，维护市场公平竞争。