公积金补缴的基数通常是根据职工上一年度的月平均工资来确定的。这一原则在多个城市的公积金政策中都有体现，比如深圳市。具体来说，公积金缴存基数为职工本人上一年度的月平均工资，这个工资包含了职工的年终奖金。对于新参加工作的职工，如应届毕业生，他们的缴存基数则是参加工作第二个月的工资。而对于新调入的职工，缴存基数则是调入单位发放工资当月的工资。

此外，公积金缴存基数还有上下限的规定。缴存基数不得低于市人力资源和社会保障部门公布的上一年度月最低工资标准，同时也不得超过国家规定的缴存基数上限。这些规定确保了公积金缴存的公平性和合理性。

在进行公积金补缴时，单位需要按照职工的实际工资和规定的缴存比例来计算应补缴的金额。如果职工的工资在缴存基数上下限之间，那么直接以实际工资作为缴存基数进行补缴即可。如果职工的工资超过了缴存基数上限或者低于下限，那么则需要按照上下限进行限制规范后再进行补缴。

总的来说，公积金补缴的基数是根据职工上一年度的月平均工资来确定的，并受到上下限的约束。单位在进行补缴时需要严格按照规定操作，确保补缴的准确性和合法性。