关于厨房燃料新能源是否合法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体的新型燃料类型、使用场景以及当地的法律法规和监管要求来综合判断。
首先，我们需要明确的是，新型燃料在厨房中的使用是受到严格监管的，这主要是出于安全考虑。以醇基液体燃料为例，它虽然被一些商家宣传为“环保油”，但实际上含有高比例的甲醇，具有易燃易爆、颜色浅泄漏不易察觉、蒸气比重大危险性强等特点。在使用、运输或存储过程中，如果处理不当，极易引发火灾、爆炸等安全事故。因此，对于这类燃料的使用，各地都有严格的监管规定。
以您提供的上海市奉贤区和邻水县的案例为例，我们可以看到：
上海市奉贤区：该区安全生产委员会办公室发布了关于组织开展餐饮行业使用新型燃料专项整治工作的通知，明确了对餐饮行业使用新型燃料的整治目标、范围和工作职责。通知中提到，对于使用醇基液体燃料的，要追溯其生产、经营、运输等全链条信息，发现非法违法生产、经营危险化学品或非法违法运输危险货物等行为的，将依法依规从严从重打击。同时，对于使用高碳链化合物燃料的，也要求摸清其生产、经营、运输等全链条信息，并对其燃料供应、现场存放使用予以规范指导。
邻水县：该县市场监管局对违规使用醇基液体燃料的农庄进行了处罚。这表明，对于未按规定使用醇基液体燃料的行为，监管部门是会进行严厉打击的。
基于以上分析，我们可以得出以下结论：
合法性取决于具体燃料类型和使用场景：并非所有新型燃料在厨房中的使用都是合法的。一些具有高危险性的燃料，如醇基液体燃料，如果未按规定使用或存储，就可能构成违法行为。
需要遵守当地法律法规和监管要求：在使用新型燃料时，必须严格遵守当地的法律法规和监管要求。这包括了解燃料的特性、使用方法、存储条件以及应急处理措施等。
建议选择安全可靠的燃料类型：为了保障厨房的安全和人员的健康，建议选择那些经过认证、安全可靠的燃料类型。同时，在使用过程中也要加强安全管理，定期检查设备、培训员工等。
最后，如果您对某种新型燃料在厨房中的使用合法性有疑问，建议您咨询当地的监管部门或专业机构以获取准确的信息和指导。