离职后三个月才结清工资是不合法的行为。以下从多个角度为你详细分析：

法律规定层面

1. 《中华人民共和国劳动合同法》第五十条：用人单位在解除或终止劳动合同时，应出具相关证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。同时，在办结工作交接时，用人单位应当支付经济补偿（如适用）并结清劳动者的工资。这意味着，从法律层面明确要求用人单位在解除或终止劳动合同时就应处理好工资结算事宜，而不是拖延至三个月后。
2. 《工资支付暂行规定》第九条：劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这一规定进一步强调了工资结算的及时性，保障劳动者在离职后能够迅速获得应得的劳动报酬。
3. 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。离职后三个月才发工资，明显超出了按月支付工资的合理范畴，属于无故拖欠工资的行为。

特殊情况处理

虽然一般情况下离职后应尽快支付工资，但也存在一些特殊情况可能导致工资延迟发放，不过这并不意味着可以无限期拖延至三个月后：

• 财务结算流程：某些公司的财务结算流程可能较长，导致工资发放有所延迟。但即便如此，公司也应积极采取措施加快结算进度，确保在合理期限内支付工资，而不是拖延三个月之久。
• 双方协商：在某些情况下，用人单位和劳动者可能会就工资支付时间进行协商并达成一致。但这种协商必须基于双方自愿，且不能违反法律法规的规定。如果未经劳动者同意，用人单位单方面决定三个月后支付工资，这种行为是不合法的。

劳动者维权途径

面对用人单位未按时支付工资的情况，劳动者可以通过以下途径维护自己的合法权益：

1. 与用人单位协商：首先尝试与用人单位沟通，要求其尽快支付拖欠的工资。这是最直接、最便捷的解决方式，有助于双方友好解决问题。
2. 向劳动监察部门投诉：若协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门提出投诉。劳动监察部门有权责令用人单位限期支付工资，并可能要求用人单位支付相应的经济补偿。
3. 申请劳动仲裁：劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请。仲裁裁决具有法律效力，用人单位必须履行。如果对仲裁裁决不服，劳动者还可以进一步向人民法院提起诉讼。
4. 提起诉讼：如果劳动者对仲裁裁决不服，可以向人民法院提起诉讼，通过司法途径进一步维护自己的权益。

建议：如果你遇到了离职后三个月才结清工资的情况，可以先与用人单位进行友好协商，明确表达自己的诉求和依据。如果协商不成，及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。