您好，关于已过追诉期的案件如何处理的问题，这是一个涉及法律程序和法律后果的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确追诉时效的概念。追诉时效是指司法机关依法追究犯罪的有效期限。一旦超过这个期限，司法机关通常就不再具有追诉的权力，这是为了保障法律的稳定性和可预测性，同时也体现了对犯罪嫌疑人或被告人人权的一种尊重。

对于已过追诉期的案件，从刑事法律的角度来看，司法机关一般不再进行追诉，即不再移送检察机关审查起诉，也不再对犯罪嫌疑人或被告人进行刑事处罚。这是因为追诉时效的经过，意味着国家放弃了针对被追诉对象的刑罚权，导致刑罚法律后果的消灭。

然而，这并不意味着犯罪行为本身被忽视或遗忘。在纪检监察机关的执纪执法过程中，对于已过追诉期但涉嫌职务犯罪的案件，仍需从党纪国法层面做出适当评价。具体来说，虽然不再从刑事犯罪层面进行追诉，但纪检监察机关仍会查清事实，并根据行为的性质和情节，将其评价为违反相应的廉洁纪律、工作纪律，或廉洁要求、工作要求等。

在定性时，纪检监察机关通常会坚持“一就是一，二就是二”的原则，不将本为涉嫌犯罪问题定性为违纪或职务违法问题。这是因为涉嫌犯罪行为的本质并未因追诉时效的经过而改变，其仍然具有严重的社会危害性和违法性。

在适用处分依据时，对于党纪处分，纪检监察机关会依据党纪处分条例的相关规定，如第二十七条，给予涉嫌犯罪的党员撤销党内职务、留党察看或者开除党籍等处分。对于政务处分，则会依据公职人员政务处分法的相关规定，给予撤职或者开除等处分。

此外，值得注意的是，追诉时效制度在法律上主要产生的是刑事责任消灭的效果。但这并不意味着犯罪嫌疑人或被告人可以完全逃避法律责任。在特定情况下，如犯罪嫌疑人或被告人逃避侦查或审判的，追诉时效可能会中断或重新计算。同时，对于某些严重犯罪，如杀人、抢劫等，法律可能规定了更长的追诉时效期限或不受追诉时效限制的情况。

综上所述，对于已过追诉期的案件，司法机关一般不再进行刑事追诉，但纪检监察机关仍会从党纪国法层面做出适当评价，并依据相关规定给予相应的党纪或政务处分。希望这个解答能够帮助您更好地理解已过追诉期案件的处理方式。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。