社保从员工工资里全部扣除是不合法的。下面我将从法律依据、社保费用分担原则、合法性分析以及员工权益保护措施等方面，为您详细解释这一问题。

一、法律依据

根据《中华人民共和国劳动法》第七十二条的规定，社会保险基金按照保险类型确定资金来源，逐步实行社会统筹。用人单位和劳动者必须依法参加社会保险，缴纳社会保险费。这明确指出了社会保险是用人单位和劳动者的共同责任，费用应由双方按照规定比例分担。

二、社保费用分担原则

社会保险费用由用人单位和劳动者共同承担，这是社保制度的基本原则。具体来说，各项社会保险的缴费比例通常如下（以部分地区为例，具体比例可能因地区而异）：

• 基本养老保险：单位缴费比例一般为16%（部分地区可能为20%），个人缴费比例为8%。
• 基本医疗保险：单位缴费比例一般为6%-10%，个人缴纳比例为2%。
• 失业保险：单位缴费比例一般为0.5%-1%（部分地区可能为1.5%），个人缴纳比例为0.3%-1%。
• 工伤保险：完全由单位缴纳，个人不承担费用，单位缴纳比例一般为0.5%-1.2%。
• 生育保险：同样由单位缴纳，个人不承担费用，单位缴纳比例通常为0.8%。

三、合法性分析

1. 合法情形：用人单位从员工工资中代扣代缴员工个人应承担的社保费用是合法的。这是用人单位履行社保缴费义务的一种方式，也是员工享受社保待遇的前提。

2. 不合法情形：如果用人单位试图将应由其承担的社保费用也转嫁到员工身上，即从员工工资中全额扣除社保费用，这是违法的。这种行为违反了社保费用的分担原则，损害了员工的经济利益。

四、员工权益保护措施

面对单位违法扣除社保费用的情况，员工可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 与公司沟通协商：首先尝试与公司进行友好沟通，明确指出公司的违法行为，并要求纠正。

2. 向劳动监察部门投诉：如果公司不予理会或拒绝纠正，员工可以向当地劳动监察部门投诉举报，寻求政府部门的帮助和支持。

3. 申请劳动仲裁：如果沟通协商和投诉均无果，员工可以向劳动仲裁机构申请仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。

综上所述，社保从员工工资里全部扣除是不合法的。员工应了解自己的社保权益和义务，及时采取措施保护自己的合法权益不受侵害。同时，相关部门也应加强监管力度，确保社保制度的公平性和有效性。