在综合工时制下，法定节假日的工资计算及休息权益是劳动者和用人单位都非常关心的问题。以下是对这一问题的详细解答：
一、法定节假日工作的工资计算
加班工资支付原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，法定休假日安排劳动者工作的，用人单位应支付不低于工资的百分之三百（300%）的工资报酬。这是法定节假日加班工资支付的基本原则。
具体计算方法：
- 法定节假日加班工资的计算公式为：加班工资基数 ÷ 21.75 × 300% × 加班天数。其中，21.75是月计薪天数，由（365天 - 104天休息日）÷ 12个月得出。
- 举例说明：若劳动者月工资标准为6000元，国庆节（法定节假日）加班1天，则其加班工资为：6000 ÷ 21.75 × 300% × 1 ≈ 827.59元。
法定节假日不计入正常工作时间：
- 在综合工时制中，法定节假日的工作时间独立核算加班工资，不计入综合计算周期内的正常工作时间。例如，若企业实行季度综合工时制，员工在该季度内正常工作时间累计未超标，但在法定节假日加班，则这加班时间按300%计算加班工资，不纳入正常工作时间判断是否超时。
二、法定节假日不上班的工资待遇
正常情况下的工资待遇：
- 在综合计算周期内，如果劳动者在法定节假日当天没有上班，一般按照正常出勤对待，即享有正常工资。用人单位无需额外支付法定节假日的加班工资，因为综合工时制主要关注的是整个周期内的总工作时长。
特殊情况下的额外补贴：
- 若用人单位的规章制度或劳动合同中有特别规定，如法定节假日不上班也给予额外补贴或福利，那么应按照该规定执行。这体现了用人单位的自主管理权和劳动者的权益保护之间的平衡。
三、注意事项与合规要求
加班工资基数的确定：
- 加班工资基数通常按劳动合同约定确定，且不得低于当地最低工资标准。若合同无明确约定，一般按劳动者本人正常劳动应得工资确定。
企业审批要求：
- 企业实行综合工时制必须经劳动行政部门审批。未经审批擅自实行，即使与劳动者有约定，也可能被认定为无效，需按标准工时制支付加班工资。
保障员工权益：
- 员工在法定节假日享有休息权利，用人单位应确保员工合法权益得到保障，合理安排工作时间，避免过度加班。同时，应依法支付法定节假日的加班工资，维护劳动关系的和谐稳定。
综上所述，综合工时制下法定节假日的工资计算及休息权益问题涉及多个方面。用人单位应严格遵守相关法律法规，确保制度的合法性和合理性；劳动者也应了解自己的权益和义务，积极维护自己的合法权益。在实际操作中遇到问题或产生纠纷时，建议及时咨询当地劳动保障部门或专业律师。