关于“取消年休假是否合法”的问题，这主要取决于取消年休假的原因和依据。根据相关法律法规和实际案例，我可以为您详细解答如下：
一、年休假是劳动者的法定权利
根据《中华人民共和国劳动法》以及《企业职工带薪年休假实施办法》的相关规定，职工连续工作满12个月以上的，有权享受带薪年休假。这是国家为了维护职工休息休假权利、调动职工工作积极性而设立的制度，属于劳动者的法定权利。
二、用人单位不得随意取消年休假
内部规章不能剥夺法定权利：用人单位可以依法制定内部规章制度，但这些规章制度的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定。例如，有些公司规定“年薪制员工不享受年休假”，这样的条款是无效的，因为它剥夺了劳动者的法定休息权利。
薪酬结构差异不是取消年休假的理由：无论劳动者是年薪制还是月薪制，都不影响其享受带薪年休假的权利。用人单位不能以薪酬结构差异为由，剥夺劳动者的这一法定权利。
三、取消年休假的合法情形
在极少数特殊情况下，如劳动者严重违反公司规章制度或法律法规，用人单位在依法解除劳动合同的同时，可能不需要支付未休年休假工资。但这种情况下的“取消”年休假，实际上是因为劳动者已经失去了享受该福利的资格，而非用人单位主动取消。
四、实际案例参考
以您提供的案例为例，某科技公司以员工是“年薪制”为由，规定员工不享受年休假福利，但法院最终判决公司需支付未休年休假工资。这充分说明了内部规章不能剥夺劳动者的法定权利，年薪制员工同样享有带薪年休假的权利。
五、建议
如果您作为劳动者遇到用人单位取消年休假的情况，首先应当查看公司的规章制度和劳动合同中是否有相关条款。如果发现这些条款违反了法律法规，您可以向劳动仲裁部门申请仲裁，要求用人单位支付未休年休假工资。同时，您也可以咨询专业律师，以更好地维护自己的合法权益。
综上所述，取消年休假一般是不合法的，除非是在劳动者严重违反公司规章制度或法律法规等特殊情况下。用人单位应当尊重劳动者的法定休息权利，合理安排年休假，确保劳动者的身心健康和工作积极性。