针对您提出的“员工自愿不交社保又申请仲裁”的问题，这是一个涉及劳动法和社会保险法的复杂情境。以下是我为您提供的详细解答：
一、核心结论
用人单位为员工缴纳社保是法定义务，不因员工自愿放弃而免除。若员工自愿不交社保后申请仲裁，用人单位仍需承担补缴社保的责任，并可能面临支付经济补偿的风险。
二、法律规定与义务解析
社保缴纳的强制性：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第七十二条和《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，用人单位和劳动者必须依法参加社会保险，缴纳社会保险费。这是双方的法定义务，具有强制性，不能通过双方约定排除。
- 员工自愿签订的不缴纳社保的协议或声明，因违反法律强制性规定而无效，不能免除用人单位的缴费责任。
员工申请仲裁的权利：
- 员工有权以用人单位未缴纳社保为由申请仲裁，这是法律赋予员工的维权途径。
- 仲裁机构通常会支持员工要求用人单位补缴社保的诉求，因为社保关乎员工的长远利益及社会公共利益。
三、仲裁可能的结果分析
补缴社保：
- 用人单位需携带相关材料到当地社保经办机构办理补缴手续，补缴金额按照当地社保政策规定的缴费基数和比例确定。
- 补缴时可能产生滞纳金，具体金额根据欠缴时间和当地政策而定。
经济补偿：
- 如果员工以用人单位未依法缴纳社会保险费为由解除劳动合同，根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位需向劳动者支付经济补偿。
- 经济补偿标准按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资。
四、用人单位应对措施
证据收集：
- 尽管不缴纳社保的约定无效，但用人单位应收集员工当时自愿不缴纳社保的相关证据，如声明书、聊天记录等。这些证据在仲裁和纠纷处理中可作为参考，反映事情经过。
积极沟通：
- 用人单位应与员工进行积极沟通，了解其诉求，争取和解。可以承诺补缴社保并在合理范围内给予补偿，以化解纠纷。
依法履行：
- 若仲裁结果要求补缴社保或支付经济补偿，用人单位应依法履行。否则，员工有权向法院申请强制执行，用人单位将面临更多法律风险和不利后果。
加强内部管理：
- 用人单位应建立健全社保缴纳制度，明确社保缴纳的流程和责任，确保今后不再出现类似问题。
- 加强员工培训与法律宣传，提高员工对社保重要性的认识及法律意识。
五、员工自身风险提醒
员工自愿不缴纳社保将面临多重风险，包括但不限于：
- 在未缴纳社保期间无法享受医疗保险待遇，生病就医费用需自行承担。
- 发生工伤时无法获得工伤保险赔偿，可能导致权益受损。
- 以自愿不缴纳社保为由申请仲裁可能影响职业声誉和未来发展。
六、总结与建议
综上所述，员工自愿不交社保并申请仲裁的情况复杂且风险较高。对于用人单位而言，应严格遵守法律法规，依法为员工缴纳社保，以避免潜在的法律风险和经济损失。同时，加强内部管理，完善社保缴纳制度，确保员工权益得到保障。对于员工而言，也应充分认识到缴纳社保的重要性，积极参与社保体系，维护自身合法权益。在面对此类纠纷时，建议双方通过友好协商或法律途径妥善解决。