当遇到员工原件丢失的情况时，处理流程和建议可以细化为以下几个步骤：

一、立即报告与确认

1. 员工报告：首先，要求员工一旦发现原件丢失，必须立即向上级主管或人力资源部门报告。
2. 确认丢失情况：接到报告后，相关部门应迅速核实丢失的原件种类、数量、重要性以及可能的影响，以便后续采取相应措施。

二、内部调查与责任认定

1. 开展内部调查：组织专门人员或小组对丢失事件进行详细调查，包括丢失的时间、地点、原因等，并尽可能找回丢失的原件。
2. 责任认定：根据调查结果，明确责任人员，并依据公司规章制度对相关人员进行处理。若涉及违法违规行为，还需考虑法律途径。

三、采取补救措施

1. 补办手续：对于可以补办的原件，如工作证、身份证等，应尽快协助员工办理补办手续。
2. 加强安全管理：针对丢失事件，加强公司的安全管理措施，如加强文件保管、限制访问权限等，防止类似事件再次发生。

四、法律与纪律处分

1. 法律途径：若丢失的原件涉及法律文件或对公司造成重大损失，可考虑通过法律途径追究责任人员的法律责任。
2. 纪律处分：根据公司规章制度，对责任人员进行相应的纪律处分，如警告、罚款、降职等。若情节严重，可考虑解除劳动合同。

五、总结与预防

1. 总结经验：对丢失事件进行总结，分析原因，提炼经验教训，以便未来更好地应对类似情况。
2. 加强培训：加强员工的安全意识和保密意识培训，提高员工对原件管理重要性的认识。
3. 完善制度：根据公司实际情况，完善相关管理制度和流程，确保原件管理的规范性和安全性。

综上所述，处理员工原件丢失事件需要综合考虑多个方面，包括立即报告与确认、内部调查与责任认定、采取补救措施、法律与纪律处分以及总结与预防等。通过全面、细致的处理流程，可以最大程度地减少丢失事件对公司和员工的影响。