关于公司补签劳动协议是否违法以及如何处理的问题，这需要根据具体情况来详细分析。
首先，我们要明确的是，如果公司在员工入职后未及时签订劳动合同，而是在一段时间后再要求员工补签，且补签的日期并非实际用工之日，这种行为可能构成违法。根据相关法律法规，用人单位自用工之日起即应与劳动者订立书面劳动合同，未及时签订的，劳动者有权要求用人单位支付未签订劳动合同期间的双倍工资。
具体到补签劳动合同的情况：
如果补签的劳动合同将日期倒签至实际用工之日，且双方对此无异议：
- 这种情况下，虽然补签行为本身可能存在一定的程序瑕疵，但法律上通常认为双方已经通过协商一致的方式对劳动关系进行了确认，因此用人单位可能无需再支付未签订劳动合同期间的双倍工资。不过，这并不意味着用人单位可以随意拖延签订劳动合同的时间，因为拖延签订本身就可能对劳动者的权益造成损害。
如果补签的劳动合同日期并非实际用工之日，或者劳动者对补签行为存在异议：
- 这种情况下，劳动者有权要求用人单位支付未签订劳动合同期间的双倍工资。因为用人单位未按照法定期限与劳动者签订书面劳动合同，已经违反了相关法律法规的规定。
针对您的情况，我建议您采取以下措施：
与公司进行沟通：
- 首先，您可以与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解公司补签劳动合同的具体原因和背景。同时，明确表达您对补签行为的看法和诉求，要求公司按照法律法规的规定进行处理。
收集证据：
- 如果公司坚持要求您补签劳动合同，且您认为补签行为可能损害您的权益，那么您需要收集相关证据来支持您的主张。例如，您可以保留入职时的相关通知、邮件、聊天记录等，以证明您实际入职的时间和公司未及时签订劳动合同的事实。
寻求法律援助：
- 如果与公司沟通无果，或者您对补签劳动合同的合法性存在严重质疑，那么您可以寻求法律援助。您可以咨询专业的劳动法律师或向当地的劳动监察部门投诉，以维护您的合法权益。
最后，我要强调的是：
- 用人单位应依法用工，及时与劳动者签订书面劳动合同，这是保障劳动者权益的基本要求。
- 劳动者在面对用人单位的违规操作时，应勇敢站出来维护自己的权益，不要因为害怕失去工作而选择沉默。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。