全资子公司的法人在母公司任职，这一行为本身是合法的。以下从不同角度为你详细分析：

法律合规性角度

从法律层面来看，并没有明确的禁止性规定限制全资子公司的法人在母公司任职。公司法等相关法律法规主要关注的是公司治理结构的合理性、董事、监事、高级管理人员的任职资格以及忠实勤勉义务等，而并未对全资子公司的法人在母公司的任职情况作出直接限制。因此，只要该法人具备相应的任职资格，且能够履行好其在母公司和全资子公司中的职责，这一行为就是合法的。

公司治理角度

1. 避免利益冲突：虽然法律上没有禁止，但从公司治理的角度来看，全资子公司的法人在母公司任职可能会引发一些利益冲突问题。例如，该法人可能会在处理母公司和全资子公司之间的事务时，难以保持完全的独立性和公正性。为了避免这种情况，公司可以在内部治理机制上加以完善，如设立独立的决策机构、加强内部审计和监督等。
2. 明确职责分工：为了确保全资子公司的法人在母公司任职时能够履行好各自的职责，公司应明确其在母公司和全资子公司中的具体职责和权限。这有助于避免职责不清导致的决策混乱和效率低下问题。

实际操作角度

1. 合同与协议：在实际操作中，全资子公司的法人在母公司任职时，应签订明确的劳动合同或服务协议，明确双方的权利和义务。这有助于保护双方的合法权益，避免潜在的纠纷。
2. 信息披露：如果全资子公司的法人在母公司担任重要职务，且该信息可能对公司的股价或投资者决策产生影响，公司应按照相关法律法规的要求进行信息披露。这有助于维护市场的公平性和透明度。

潜在风险与应对

尽管全资子公司的法人在母公司任职是合法的，但也可能存在一些潜在风险，如利益输送、关联交易等。为了应对这些风险，公司应加强内部控制和风险管理，建立健全的关联交易审批和披露机制，确保所有交易都符合法律法规和公司章程的规定。

总结与建议：全资子公司的法人在母公司任职是合法的，但公司应关注可能引发的利益冲突问题，并通过完善内部治理机制、明确职责分工、签订合同与协议以及加强信息披露等措施来降低潜在风险。如果你在这一过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。