结论：公司规定旷工三天算自动离职是否合法，主要取决于公司的规章制度是否合法有效且明确规定了旷工三天的后果。若规章制度合法有效且明确规定了旷工三天的后果，则公司可据此解除劳动合同；否则，公司不能随意将旷工三天的员工视为自动离职。

一、法律层面分析

1. 法律无明确规定：我国法律并未明确统一规定旷工多少天即构成自动离职。自动离职在法律上并非规范表述，它通常指的是劳动者不告而别、无故旷工达到一定合理期限，并表现出不再继续履行劳动合同的意思。

2. 用人单位规章制度制定权：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位有权制定规章制度，但这些规章制度必须符合法律规定，不得违反法律法规的强制性规定，且需经过民主程序制定并向劳动者公示。

二、用人单位规章制度分析

1. 规章制度内容：许多公司会在规章制度中明确规定，连续旷工3天或累计旷工达到一定天数（如15天）可视为严重违纪行为，并作为解除劳动合同的情形之一。这一规定必须合法、合理且经过公示。

2. 规章制度有效性条件：

   • 内容合法合理：规章制度的内容不得违反法律法规，应符合企业管理逻辑和公平原则。
   • 经过民主程序制定：规章制度通常需要经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定。
   • 已向劳动者公示：公司需要通过发放员工手册、组织培训、公告栏张贴等方式确保员工知晓规章制度的内容。

三、实际应用中的分析与建议

1. 对于劳动者：

   • 遵守公司规章制度：劳动者应严格遵守公司的规章制度，按时出勤，以维护自身的合法权益。
   • 了解自身权益：若认为公司规章制度中存在不合理或不合法的条款，劳动者有权向相关部门投诉或寻求法律援助。
   • 保留证据：在面临可能的劳动纠纷时，劳动者应保留好相关证据，如考勤记录、工资单、公司规章制度等，以便在需要时维护自己的权益。

2. 对于用人单位：

   • 制定合法有效的规章制度：公司应制定合法有效的规章制度，并确保其内容合理、经过民主程序制定且已向劳动者公示。
   • 依法处理旷工问题：在处理旷工问题时，公司应依据规章制度进行，避免违法解除劳动合同的法律风险。若员工旷工行为严重违反公司规章制度，公司可以依法解除劳动合同，但应确保解除程序的合法性和合理性。
   • 妥善处理工资结算等问题：即使员工因旷工被认定为自动离职，公司也应按照法律规定结清员工在职期间的工资，不能随意克扣。

四、具体案例分析

假设某公司规章制度中明确规定：“连续旷工3天或一年内累计旷工5天，视为严重违反公司规章制度，公司有权解除劳动合同。”若某员工连续旷工3天，且该规章制度已经过民主程序制定并向员工公示，则公司可以依据此规定解除与该员工的劳动合同。反之，若公司规章制度中未明确规定旷工三天的后果，或规章制度未经过民主程序制定或未向员工公示，则公司不能随意将旷工三天的员工视为自动离职。

综上所述，公司规定旷工三天算自动离职是否合法，关键在于公司的规章制度是否有明确规定，并且该规章制度是否符合法律法规的要求。劳动者和用人单位都应充分了解相关法律法规和规章制度，以确保自身权益得到妥善保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。