关于超市对员工罚款是否合法的问题，这需要根据具体的法律法规和实际情况来综合判断。一般而言，超市作为非行政机关，并不具备直接对员工进行罚款的法律权利。以下是对此问题的详细分析：
一、罚款权的归属
罚款是行政处罚的一种形式，根据《中华人民共和国行政处罚法》的规定，罚款只能由具有行政处罚权的行政机关在法定职权范围内依照法定程序实施。超市作为企业，并不具备这样的行政处罚权，因此，从法律层面讲，超市无权直接对员工进行罚款。
二、企业规章制度的合法性
虽然超市有权制定规章制度来管理员工，但这些规章制度必须严格遵守法律法规的强制性规定。如果超市的规章制度中包含了罚款条款，这些条款很可能因违法而无效。员工在面对此类违法罚款时，有权拒绝遵守，并可以通过合法途径维护自己的权益。
三、员工权益的保障与救济途径
协商沟通：员工在面对超市的不合理罚款时，首先可以尝试与超市管理层进行沟通协商，寻求解决方案。
投诉举报：如果协商无果，员工可以向当地劳动行政部门投诉或举报超市的违法罚款行为。劳动行政部门将依法进行调查处理，并责令超市改正。
劳动仲裁或诉讼：员工还可以选择申请劳动仲裁或提起诉讼来维护自己的合法权益。如果因为超市的违法罚款行为给员工造成了损害，超市还应当承担相应的赔偿责任。
四、超市合法管理员工的建议
制定合法规章制度：超市应当制定合法、合规的规章制度，明确员工的权利和义务，以及违规行为的处理程序和标准。这些规章制度应当经过职工代表大会或全体职工的讨论，确保内容的合法性和合理性。
采取合法管理措施：对于员工的违规行为，超市可以采取警告、记过、降级、调岗、解除劳动合同等合法的内部管理措施进行处理，但不得采取罚款的方式。
加强员工培训：超市应当加强对员工的法律法规培训，提高员工的法律意识和合规意识，减少违规行为的发生。
总结
超市对员工进行罚款是不合法的行为，不仅违反了法律法规的规定，也损害了员工的合法权益。超市应当依法经营，通过合法合规的手段来管理员工，确保企业的稳定发展和员工的合法权益得到保障。员工在面对超市的不合理罚款时，应当积极采取措施维护自己的权益。