关于“超市上班罚款是否违法”的问题，我们可以从法律层面和员工权益保护角度进行详细分析。
一、法律层面分析
超市无直接罚款权：
- 罚款作为行政处罚的一种，根据《中华人民共和国行政处罚法》的规定，只能由国家行政管理机关或法律授权的机构在法定职权范围内依照法定程序实施。超市作为企业，并不具备行政处罚权，因此无权对员工进行罚款。
企业规章制度的合法性：
- 虽然用人单位有权制定规章制度来管理员工，但这些规章制度必须遵守法律法规的强制性规定，不能包含罚款等行政处罚内容。如果超市的规章制度中包含了罚款条款，这些条款将因违法而无效，员工有权拒绝遵守。
特定条件下的合理性探讨：
- 在极少数情况下，如果超市制定了完善的内部规章制度，这些规章制度经过了民主程序制定（如职工代表大会讨论通过），并向员工公示，且罚款目的是为了弥补员工过错导致的经济损失，同时罚款数额合理，不过度影响员工的基本生活和合法权益，那么这种罚款可能具有一定的合理性。但这种情况非常特殊，且必须严格遵守法律法规和内部规章制度。
二、员工权益保护角度
过度罚款的危害：
- 超市滥用罚款权力，设定高额罚款标准，会严重损害员工的经济利益，影响工作积极性和生活品质。这与法律保护劳动者合法权益的宗旨相悖。
员工的法律救济途径：
- 当员工认为超市罚款行为不合理或不合法时，有权向当地劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如果因为超市的违法罚款行为给员工造成了损害，超市还应当承担赔偿责任。
三、合法处理员工过错的方式
对于员工的违规行为，超市应当采取合法合规的手段进行处理，如：
- 协商解决：与员工进行沟通，了解事情原委，尝试通过协商达成解决方案。
- 依据规章制度处理：依据合法的内部规章制度对员工进行警告、记过、降级、调岗、解除劳动合同等处理，但不得采取罚款的方式。
- 要求赔偿损失：若员工行为确给超市造成经济损失，超市可要求员工按劳动合同或规章制度规定赔偿，但需提供充分证据，并确保赔偿金额合理。
总结：
超市对员工进行罚款，一般情况下是违法的。超市应依法管理员工，尊重员工的合法权益，通过合法合规的手段来处理员工的违规行为。员工在面对不当罚款时，应依法维护自己的合法权益，可以向当地劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁。同时，超市也应当制定合法的规章制度，明确员工的权利和义务，以及违规行为的处理程序和标准，确保企业的稳定发展和员工的合法权益得到保障。