全勤奖通常应包含在工资总额内，但不属于基本工资（标准工资）的范畴。以下是对这一问题的详细分析：
一、全勤奖的性质与归属
全勤奖是用人单位为激励员工保持全勤、提高工作积极性和效率而设立的一种奖励制度。它基于员工的正常出勤和劳动付出，是对员工工作表现的一种额外报酬。从性质上讲，全勤奖属于奖金范畴，是工资总额的一个组成部分。根据《关于工资总额组成的规定》，工资总额包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资以及特殊情况下支付的工资。因此，全勤奖作为奖金的一种，应计入工资总额。
二、全勤奖与基本工资的区别
基本工资：是劳动者在法定工作时间内提供正常劳动所得的报酬，是构成劳动者月收入的基本组成部分，具有相对稳定性。它主要用于维持劳动者的基本生活需要，并根据劳动合同约定或国家及企业规章制度规定的工资标准来确定。
全勤奖：则是基于员工的出勤状况而额外发放的奖励性收入。它并非员工正常工作必然获得的报酬，而是对员工在一定时期内保持全勤的额外奖励。如果员工当月有缺勤情况，就可能无法获得全勤奖，但这并不影响其基本工资的发放。
三、全勤奖的发放与扣除
发放条件：全勤奖的发放标准和条件由用人单位自行决定，通常会与员工的出勤情况、工作任务完成情况等挂钩。员工只有满足全勤奖的发放条件，用人单位才会予以发放。
扣除规定：如果员工因个人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可以按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。在这种情况下，经济损失的赔偿可以从员工的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。这里的“工资”指的是包括基本工资、奖金（如全勤奖）等所有劳动报酬的总和。
四、法律保障与劳动者权益
用人单位在计算加班工资基数、经济补偿金等涉及工资相关的项目时，应将全勤奖作为工资的一部分予以考虑。如果用人单位故意不将全勤奖计算在内，可能构成违法行为，劳动者有权通过合法途径维护自身权益，包括但不限于向劳动监察部门投诉、提起劳动仲裁或诉讼等。
五、特殊情况的处理
在实践中，如果劳动合同明确约定全勤奖包含在基本工资内，或者公司规章制度有这样的明确规定，并且用人单位能够对该约定或规定的合理性及明确性承担举证责任，那么从其约定或规定。但这种情况相对较少，且需要确保相关规定的合法性和合理性。
总结与建议：
全勤奖作为奖金的一种形式，虽然不属于基本工资范畴，但应包含在工资总额内。其发放与扣除需严格遵循劳动合同、单位规章制度及相关法律法规。作为劳动者，应了解自己的权益，确保在全勤奖的发放与扣除过程中得到公平对待。如果用人单位在全勤奖的发放或扣除方面存在违法行为，劳动者有权通过合法途径维护自身权益。
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