公司若怀疑员工吃回扣，需收集以下核心证据方可立案，具体可分为直接证据与间接证据两类：

1. 直接证据：明确指向员工收受回扣的客观材料

   • 书面协议或记录：如员工与供应商签订的“好处费”协议、回扣比例约定、分账记录等书面文件。
     
   • 资金往来凭证：银行转账记录、现金收据、微信/支付宝转账记录等，需显示员工账户直接接收供应商或第三方款项。
     
   • 录音/录像：员工承认收受回扣的对话录音、视频（需合法取得，如公开场合录制或经同意录制）。
     
   • 证人证言：供应商、同事或其他知情人指认员工索要或收受回扣的书面证词（需证人出庭作证或签署真实陈述保证）。
     

2. 间接证据：形成完整证据链的辅助材料

   • 异常交易记录：如供应商突然提高报价、员工经手的采购价格明显高于市场价、频繁更换供应商且无合理理由。
     
   • 员工行为异常：如员工生活水平突然提升（购买奢侈品、频繁旅游）、与供应商关系过于密切（私下聚餐、互赠礼品）。
     
   • 公司制度漏洞：如采购流程缺乏审批、合同未留存原件、财务报销不规范等，可能间接证明员工利用漏洞谋利。
     
   • 电子数据：员工与供应商的邮件、聊天记录中提及“回扣”“好处费”等关键词（需公证或通过技术手段固定证据）。
     

立案关键点：

• 证据需形成完整链条，仅凭单一证据（如单次转账记录）可能不足以立案，需结合其他材料证明“员工主观故意”与“回扣与职务行为直接关联”。
  
• 若涉及刑事案件（如非国家工作人员受贿罪），需向公安机关经侦部门报案，由警方调查取证；若为内部纪律处分，公司可依据规章制度处理，但需确保程序合法（如工会参与、员工申辩权）。
  

建议行动：

1. 立即固定现有证据（如截图、复印、公证），避免员工销毁或转移；
   
2. 委托律师协助调查，通过合法手段获取关键证据（如申请法院调查令查询银行流水）；
   
3. 若证据充分，可同时向公安机关报案并启动内部追责程序，最大化维护公司权益。
   

如有具体案件细节或证据材料，可进一步向我咨询，我会结合实际情况为您分析证据效力与立案可行性。