公司辞退补偿一般是按照劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资来计算，这里的平均工资是应发工资，而非基本工资或实发工资，但具体计算时会有一些细节需要注意。以下是对这一问题的详细分析：

一、法律规定

根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条的规定：“经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。”

二、工资构成与计算

1. 应发工资与实发工资：

   • 应发工资：即劳动者当月应得的全部工资收入，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等所有货币性收入。
   • 实发工资：即劳动者实际到手的工资，是应发工资扣除社保、公积金、个税等费用后的金额。

2. 计算经济补偿时的工资标准：

   • 根据法律规定，经济补偿的计算基数是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，这里的平均工资指的是应发工资，而非基本工资或实发工资。
   • 如果劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的工资存在异常（如病假工资、事假工资等），则可能需要根据实际情况进行调整，以确保计算的经济补偿公平合理。

三、特殊情况下的处理

1. 高收入劳动者：

   • 如果劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，那么经济补偿的计算标准将按照职工月平均工资三倍的数额支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。

2. 工资支付周期不完整：

   • 如果劳动者在用人单位的工作年限不足十二个月，或者劳动合同解除、终止前的工资支付周期不完整（如新入职员工），那么经济补偿的计算将按照实际工作月份的平均工资进行。

四、实际案例与操作建议

• 实际案例：假设某劳动者在用人单位工作了5年，劳动合同解除前十二个月的应发工资总额为60,000元（即月平均工资为5,000元），那么该劳动者应获得的经济补偿为5个月×5,000元/月=25,000元。
• 操作建议：在计算经济补偿时，劳动者和用人单位应共同确认劳动合同解除或者终止前十二个月的应发工资总额，并据此计算平均工资和经济补偿金额。如果双方对工资总额或计算方式存在争议，可以寻求劳动仲裁或诉讼解决。

总结来说，公司辞退补偿的计算基数是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，这里的平均工资指的是应发工资。在计算时，需要注意工资构成、特殊情况下的处理以及实际案例与操作建议等方面的问题。如果你对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。