结论：没在公司上班是否发工资是否违法，需根据具体情况和法律规定来判断。合法情况下可以不发或发放部分工资，但违法虚构劳动关系或侵占单位财产则可能面临法律责任。以下从不同角度进行详细分析：
一、不违法的情形及法律依据
合法的协议约定
- 当员工处于法定的医疗期内，企业应根据《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》支付病假工资，且不得低于最低工资标准的80%。这是基于劳动合同和法律规定的合法权益，即使员工未实际到公司上班，企业仍需支付相应工资。
协商一致的待岗安排
- 若因企业经营困难等原因与员工协商一致安排待岗，根据《工资支付暂行规定》，在停工、停产的一个工资支付周期内，应按劳动合同规定支付工资；超过此周期且员工未提供正常劳动时，应支付不低于当地最低工资标准一定比例的生活费。这种情况下，即使员工未上班，企业仍需支付部分工资或生活费。
履行社会责任的自愿行为
- 企业出于人道主义关怀或社会责任，自愿资助特定人员（如贫困学生），这种行为不属于劳动法意义上的工资支付，而是合法的赠予或资助。这种情况下，即使受资助者未在公司上班，也不涉及违法问题。
员工违规未上班
- 若员工无故旷工或违反公司规定而未上班，公司应有明确的规章制度进行处罚，如警告、罚款乃至解除劳动合同。但在此情况下，公司不能简单选择不发工资，因为员工付出劳动即应获得相应报酬。不过，公司可依据规章制度扣减相应工资作为处罚，但需确保扣减后的工资不低于当地最低工资标准。
二、违法的情形及法律后果
虚构劳动关系套取资金
- 如果企业与所谓的“员工”不存在真实劳动关系，为了套取国家补贴、骗取贷款或虚增成本等非法目的而虚构员工并发放工资，这种行为涉嫌诈骗或逃税。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，可能面临三年以下有期徒刑至无期徒刑及罚金的处罚，或者税务机关将追缴税款、滞纳金，并处以罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
侵占单位财产
- 企业管理人员利用职务之便，给不存在真实劳动付出的亲友等人员发放工资，将单位资金占为己有，可能构成职务侵占罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，可能面临五年以下有期徒刑至五年以上有期徒刑及没收财产的处罚。
三、建议与总结
对于企业：在处理员工不上班的问题时，应遵循相关法律法规，确保人事管理政策合法合规。对于不同情况应采取不同的处理措施，不能一概而论地选择不发工资。遇到复杂情况或有疑问时，可直接向我咨询，以确保企业行为的合法性并维护员工的合法权益。
对于员工：如果因特殊原因未能到公司上班，应与公司进行积极沟通，了解公司的相关政策和规定，并确保自己的权益得到保障。如果公司存在违法行为，如虚构劳动关系或侵占单位财产等，员工有权向相关部门进行投诉或举报。
总之，没在公司上班是否发工资是否违法，需根据具体情况和法律规定来判断。企业和员工都应了解相关法律法规，确保自己的行为合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。