针对您提出的“只有发票的车库买卖是否合法”的问题，以下是我的详细解答：
首先，我们需要明确，发票是交易的一种凭证，但它本身并不直接决定交易的合法性。交易的合法性主要取决于交易过程是否符合相关法律法规的规定。
对于车库买卖而言，其合法性主要取决于以下几个方面：
产权清晰度：
- 车库是否具有明确的产权归属是判断买卖合法性的关键。如果车库产权清晰，无争议，那么买卖行为就更有可能是合法的。
- 反之，如果车库产权存在争议或不明确，那么买卖行为就可能存在法律风险。
交易过程合规性：
- 买卖双方需要签订正式的买卖合同，并明确双方的权利和义务。
- 交易过程需要遵循相关法律法规，如办理产权过户手续、缴纳相关税费等。
相关法规遵守情况：
- 根据您提供的参考信息，某些地区（如太原市）有专门的《房地产开发项目车位和车库租售管理办法》来规范车位、车库的租售行为。
- 在这些地区，车库买卖需要符合该《办法》的相关规定，如首先满足本建筑区划内业主的需要、纳入商品房租售管理、办理预售许可或现售备案手续等。
现在，我们回到您的问题“只有发票的车库买卖是否合法”。发票只是交易的一种凭证，它不能单独证明交易的合法性。要判断车库买卖的合法性，还需要考虑上述提到的产权清晰度、交易过程合规性以及相关法规的遵守情况。
因此，如果您正在考虑购买或出售车库，并且只有发票作为交易凭证，我建议您：
- 核实车库的产权归属情况，确保产权清晰无争议。
- 了解并遵守当地关于车库买卖的相关法律法规和规定。
- 在交易过程中，确保签订正式的买卖合同，并办理相关手续，如产权过户、税费缴纳等。
综上所述，只有发票并不能直接证明车库买卖的合法性。要判断交易的合法性，还需要综合考虑多个方面。希望这些解答能对您有所帮助。