结论：公司能否查出员工是否已婚已育，取决于员工信息的公开程度、公司的调查手段以及是否涉及侵犯员工隐私权等因素。在大多数情况下，公司直接查询员工婚姻和生育状况可能涉及侵犯隐私权，因此不建议公司采取直接查询的方式。
详细分析：
员工信息的公开程度：
- 如果员工在入职时或工作过程中，自愿或根据公司要求提供了婚姻和生育状况的相关信息，并且这些信息在公司内部是公开的或至少对特定管理层是可见的，那么公司自然能够“知道”这些信息。但这种情况下的“知道”是基于员工的自愿提供，而非公司的主动查询。
公司的调查手段：
- 公司通常不会直接查询员工的婚姻和生育状况，因为这可能涉及侵犯员工的隐私权。隐私权是每个人的基本权利，受到法律的保护。除非有特定的法律要求或员工同意，否则公司无权直接查询或获取这些信息。
- 如果公司试图通过非法手段（如黑客攻击、窃取个人信息等）获取员工的婚姻和生育状况，这不仅违反了法律，还可能面临严重的法律后果，包括罚款、赔偿损失甚至刑事责任。
涉及侵犯员工隐私权的情况：
- 在大多数情况下，员工的婚姻和生育状况属于个人隐私范畴，受到法律的保护。公司如果未经员工同意，擅自查询或传播这些信息，可能构成侵犯隐私权的行为。
- 侵犯隐私权的行为可能引发法律纠纷，导致公司面临法律责任和声誉损失。因此，公司应该尊重员工的隐私权，避免进行不必要的查询或传播。
法律建议：
- 对于公司：建议公司不要试图直接查询员工的婚姻和生育状况。如果公司需要了解这些信息以进行某些特定的管理或福利安排（如产假、育儿假等），应该通过合法、合规的方式获取，如要求员工自愿提供或通过相关政府部门进行查询（在符合法律要求的情况下）。
- 对于员工：如果员工发现公司未经同意查询或传播其婚姻和生育状况，可以与公司进行沟通，要求公司停止侵权行为并删除相关信息。如果公司拒绝配合，员工可以向相关部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果公司未经员工同意查询或传播其婚姻和生育状况，可能面临法律纠纷和声誉损失。在严重的情况下，公司还可能面临罚款、赔偿损失甚至刑事责任等法律后果。
总之，公司能否查出员工是否已婚已育并不是一个简单的问题，它涉及到员工信息的公开程度、公司的调查手段以及是否涉及侵犯员工隐私权等多个方面。因此，建议公司尊重员工的隐私权，避免进行不必要的查询或传播。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。