自动离职后，员工在符合一定条件下确实可以申请劳动仲裁来解决与用人单位之间的劳动争议。以下是对此问题的详细分析：
一、可以申请劳动仲裁的常见情形
未签订劳动合同：
- 根据《劳动合同法》，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应向劳动者每月支付二倍的工资。因此，即使自动离职，劳动者仍有权申请劳动仲裁要求支付双倍工资差额。
未支付劳动报酬：
- 用人单位应按时足额支付劳动报酬。若存在拖欠或克扣工资情况，劳动者离职后可申请劳动仲裁要求支付拖欠的工资。
未缴纳社会保险：
- 用人单位和劳动者需依法参加社会保险并缴费。如用人单位未为劳动者缴纳社保，劳动者离职后可申请劳动仲裁要求补缴。
加班未支付加班费：
- 用人单位安排劳动者加班的，应按法定标准支付加班费。若未支付，劳动者离职后可申请劳动仲裁要求支付加班费。
其他因劳动合同履行而产生的争议：
- 如涉及工伤待遇争议、竞业限制补偿金争议等，劳动者在离职后同样有权申请劳动仲裁。
二、申请劳动仲裁的时效限制
- 一般时效：根据《劳动争议调解仲裁法》，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。这意味着，如果劳动者在自动离职后认为自己的权益受到了侵害，他/她需要在离职后一年内提起劳动仲裁。
- 特殊时效规定：对于劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生的争议，劳动者申请仲裁不受上述一年仲裁时效期间的限制。但是，一旦劳动关系终止（包括自动离职），劳动者仍需在劳动关系终止之日起一年内提出仲裁申请。
- 时效中断与中止：
- 时效中断：因当事人一方向对方主张权利、向有关部门请求权利救济或对方当事人同意履行义务而中断，从中断时起重新计算。
- 时效中止：因不可抗力或其他正当理由导致无法在时效期间内申请仲裁的，仲裁时效中止，待中止原因消除后继续计算。
三、申请劳动仲裁的条件
- 申请人与本案有直接利害关系。
- 有明确的被申请人及基本信息。
- 有具体的仲裁请求和事实、理由，且请求应具体明确，事实和理由需围绕劳动争议相关事宜。
- 属于劳动争议仲裁委员会的受理范围，如确认劳动关系、劳动合同订立、履行、变更、解除和终止等争议。
四、申请劳动仲裁需准备的材料
- 劳动仲裁申请书：载明劳动者和用人单位的基本信息、仲裁请求、事实和理由等。
- 证据材料：包括劳动合同、工资条、考勤记录、加班记录、社会保险缴纳记录等，用于证明劳动关系及用人单位的违法行为。
- 身份证明：劳动者的身份证复印件等有效身份证明材料。
五、综合建议
自动离职后的员工在申请劳动仲裁时，应首先确认自己的权益是否受到侵害，并检查是否满足申请劳动仲裁的条件。同时，要注意仲裁时效的限制，确保在规定的时效期内提出申请。在准备申请材料时，应尽量收集全面、客观的证据来支持自己的仲裁请求。如果遇到复杂情况或不确定如何操作，可以直接向我咨询，我会为你提供更具体的法律建议和帮助。