合同上注明“不含税”并不一定违法，但其合法性取决于具体的交易内容、相关法律法规以及合同的具体约定。以下是对此问题的详细分析：
一、合同自由与意思自治
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方在平等、自愿、公平的基础上，有权就合同的各项条款进行协商并达成一致意见，这包括价款是否含税等条款。只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么合同就是合法有效的。因此，从合同自由的角度来看，合同中注明不含税价格属于当事人意思自治的范畴，法律并不禁止。
二、纳税义务的法定性
税法明确规定了各类税种的纳税义务人以及纳税义务。无论合同如何约定价格，销售货物或者提供劳务等经营行为的纳税义务是法定的。这意味着，即使合同中注明了不含税价格，销售方仍然需要按照税法规定计算并缴纳相应的税款，如增值税、企业所得税等。购买方也可能需要根据实际情况承担一部分税款，这取决于双方的进一步约定。
三、合同条款的合法性与有效性
要判断合同中注明“不含税”的条款是否合法，还需考虑以下几个关键点：
交易或服务的纳税性质：如果根据相关法律法规，该交易或服务需要缴纳税款，那么合同中注明的“不含税”并不能免除双方的纳税义务。若因此导致未依法纳税，相关方可能会面临法律风险和税务部门的处罚。
法律法规的强制性规定：如果税法等相关法律明确规定某些交易或服务的价款应当包含税款，并且不允许通过合同约定来规避纳税义务，那么合同中注明“不含税”的条款就可能是违法的，这样的条款可能被视为无效。
合同的具体内容和上下文：在某些情况下，合同中注明“不含税”是为了明确交易价格中不包含税款的部分，以便双方更清晰地了解交易的实际成本。但这并不意味着可以逃避纳税义务，而是需要在合同之外另行处理税款的问题。例如，双方可以约定由哪一方负责缴纳税款、何时缴纳、提供何种类型的发票等。
四、实际操作中的建议
明确约定：在签订合同时，双方应明确约定价格是否含税，并对税款的承担、发票的开具等事项作出详细、清晰的约定。这有助于避免后续争议和法律风险。
咨询专业意见：鉴于合同注明不含税可能会引发一些税务风险和纠纷，建议在签订合同时咨询专业的法律顾问或税务专家。他们可以根据具体的交易内容和相关法律法规，为你提供有针对性的建议和指导。
依法纳税：无论合同如何约定，双方都应严格遵守国家法律法规的强制性规定，依法履行纳税义务。这不仅是法律的要求，也是维护自身权益和避免法律风险的重要保障。
举例说明：假设你是一家企业的负责人，与另一家企业签订了一份货物买卖合同。合同中约定货物单价为100元/件，此价格不含税。那么，在签订合同时，你们应明确约定由哪一方负责缴纳增值税等税款，并约定在何时、以何种方式开具发票。这样，即使合同中注明了不含税价格，也能确保双方的权益得到保障，并避免后续的法律风险和税务纠纷。
综上所述，合同上注明“不含税”并不一定违法，但双方需确保这一约定符合法律法规的要求，并详细约定相关的税务事项。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。