上班漏打卡扣工资是否合法，需分情况讨论：

1. 若公司规章制度合法且已告知员工：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或决定有关劳动报酬、工作时间等直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，应当经职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定，并公示或告知劳动者。
   • 如果公司有明确的规章制度规定漏打卡将扣工资，且该制度已经过上述法定程序制定并公示或告知了员工，同时该制度内容不违反法律、行政法规及政策规定，不存在明显不合理的情形，那么公司因员工漏打卡而扣工资的行为可能是合法的。但即便如此，扣除的工资数额也不得超过员工当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。

2. 若公司规章制度不合法或未告知员工：

   • 如果公司没有明确的规章制度规定漏打卡将扣工资，或者该制度未经法定程序制定、未公示或告知员工，那么公司因员工漏打卡而扣工资的行为就是违法的。
   • 此外，即使公司有规章制度，但如果该制度内容违反法律、行政法规及政策规定，或存在明显不合理的情形（如扣除工资数额过高），那么该制度也是无效的，公司不能依据该制度扣工资。

法律建议：

• 对于员工：如果公司因漏打卡而扣工资，且你认为公司的行为不合法或不合理，你可以先与公司协商解决。如果协商不成，你可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 对于公司：建议公司制定合法、合理的规章制度，并确保这些制度经过法定程序制定、公示或告知员工。同时，公司在执行规章制度时，应当遵循公平、公正、合理的原则，避免侵犯员工的合法权益。

可能后果：

• 如果公司违法扣工资，除了需要补发工资外，还可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款等。
• 如果员工因此与公司产生纠纷并申请劳动仲裁或提起诉讼，公司还可能面临支付赔偿金、承担诉讼费用等法律后果。

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