分公司未注册是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：
相关法律规定
- 市场主体登记要求：根据《中华人民共和国市场主体登记管理条例》第三条，市场主体应当依照本条例办理登记。公司作为典型的市场主体，其分公司也属于市场主体的一部分，必须完成工商注册登记，方可开展经营活动。未经登记，不得以市场主体名义从事经营活动（法律、行政法规另有规定的除外）。分公司作为公司的分支机构，其设立和运营同样需要遵循这一规定。
- 公司法规定：虽然《中华人民共和国公司法》主要规范的是公司的设立、组织、运营等，但分公司作为公司的组成部分，其设立和运营也间接受到公司法的约束。公司设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照，这是分公司合法存在和运营的前提。
具体法律后果
- 行政处罚：
- 根据《中华人民共和国市场主体登记管理条例》第四十三条，未经设立登记从事经营活动的，登记机关将责令改正并没收违法所得。若拒不改正，将面临1万元至10万元的罚款；情节严重者，更将被责令关闭停业，并处以10万元至50万元的罚款。分公司未注册即经营，同样会面临这样的行政处罚。
- 刑事责任追究：
- 依据《无证无照经营查处办法》，对于无证无照经营且情节严重的行为，不仅会受到行政处罚，还可能构成犯罪，依法被追究刑事责任。虽然分公司未注册经营本身不一定直接构成犯罪，但如果其经营活动触犯了刑法中的相关规定，如非法经营罪，那么相关责任人仍可能面临刑事处罚。
- 合同效力与民事责任：
- 未经工商注册的分公司签订的合同，虽不一定无效，但因签约主体可能不明确或不合法，会给合同履行及当事人权益保障带来风险。如产生纠纷，对方可能以签约主体不合法为由主张合同无效或可撤销。
- 未注册分公司不能独立承担民事责任。经营过程中产生的债务或侵权纠纷，责任将由总公司或实际行为人承担。若造成损失，总公司或实际经营者需以个人或公司财产赔偿，且因不具备合法主体资格，债权人维权时可能面临更多困难。
注册的重要性
- 合法经营：分公司注册是取得合法经营资格的必经程序，只有经过注册，分公司才能以独立的（在总公司授权范围内）或相对独立的身份从事经营活动，享受法律保护。
- 权益保护：通过注册，分公司可以获得一定的法律地位，有助于提升企业的信誉度和市场竞争力。同时，注册也有助于保护分公司的合法权益，如知识产权、商业秘密等。
- 规避风险：遵循法定程序完成分公司注册，可以有效避免上述提到的法律风险和经济损失，为分公司稳健发展奠定坚实基础。
总结与建议：
分公司未注册即经营是不合法的，且将面临严重的法律后果和经营风险。为了保障分公司的合法性和稳健发展，避免不必要的法律风险和经济损失，所有打算设立分公司的企业和个人务必按照法定程序完成分公司的注册登记手续。如果你在分公司注册或运营过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。