合作关系下发工资一般不适用劳动仲裁，但具体需根据合作关系的性质来判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、合作关系的法律性质

1. 合作关系与劳动关系的区别：

   • 合作关系通常是基于平等、自愿的原则，双方就特定项目或任务进行合作，各自承担风险并分享收益。在合作关系中，双方一般不存在隶属关系，即一方不受另一方的管理和支配。
   • 劳动关系则是指劳动者与用人单位之间，依法所确立的劳动过程中的权利义务关系。在劳动关系中，劳动者通常需要遵守用人单位的规章制度，接受用人单位的管理和支配，并从用人单位处获得劳动报酬。

2. 合作关系的法律适用：

   • 合作关系一般受《中华人民共和国民法典》等民事法律规范的调整，而不是受《中华人民共和国劳动法》或《中华人民共和国劳动合同法》等劳动法律规范的调整。

二、劳动仲裁的适用范围

1. 劳动仲裁的定义：

   • 劳动仲裁是指劳动争议仲裁委员会对当事人申请仲裁的劳动争议居中公断与裁决。在我国，劳动仲裁是劳动争议当事人向人民法院提起诉讼的必经程序。

2. 劳动仲裁的适用范围：

   • 劳动仲裁主要适用于因确认劳动关系发生的争议、因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议、因除名、辞退和辞职、离职发生的争议、因工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护发生的争议、因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议等。

三、合作关系发工资是否适用劳动仲裁的分析

1. 一般情况：

   • 如果双方之间是合作关系，而非劳动关系，那么一方给另一方发工资的行为通常不被视为劳动报酬的支付，而是合作收益的分配。在这种情况下，如果双方就工资支付问题发生争议，一般不适用劳动仲裁程序，而是应该通过民事诉讼或其他途径解决。

2. 特殊情况：

   • 如果双方之间的合作关系实际上构成了劳动关系（例如，一方虽然名义上是合作伙伴，但实际上却长期、稳定地为另一方提供劳动，并接受另一方的管理和支配），那么在这种情况下，一方给另一方发工资的行为就可能被视为劳动报酬的支付。此时，如果双方就工资支付问题发生争议，就可以适用劳动仲裁程序。

四、建议

1. 明确合作关系的性质：

   • 在签订合作协议时，双方应该明确合作关系的性质、权利义务关系以及争议解决方式等条款，以避免未来可能出现的争议。

2. 寻求法律帮助：

   • 如果双方就工资支付问题发生争议，且无法自行协商解决，建议寻求专业的法律帮助。律师可以根据具体情况分析合作关系的性质以及争议解决方式，并提供相应的法律建议。

3. 保留证据：

   • 无论双方之间是合作关系还是劳动关系，都应该保留好与工资支付相关的证据（如合作协议、工资支付记录、工作记录等），以便在发生争议时能够证明自己的权益。

如果你有具体的合作情况或争议问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。