公司按年发工资是否合法，需分情况讨论：
如果公司与员工协商一致，且不违反法律法规的强制性规定，按年发工资是合法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。但这里的关键是“按月支付”并非绝对，如果双方有特别约定，并且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么按年支付工资也是可以的。
- 实际操作：在实际操作中，一些公司可能会因为业务特点、资金流转等原因，与员工协商按年支付工资。这种情况下，只要双方达成一致，并且公司能够确保在约定的时间内足额支付工资，就不违反法律规定。
如果公司未经员工同意，单方面决定按年发工资，则可能违法。
- 法律依据：同样根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当按月支付，这是法律对工资支付方式的基本要求。如果公司未经员工同意，单方面改变工资支付方式，就可能构成违法行为。
- 法律后果：如果公司违法按年支付工资，员工有权向劳动监察部门投诉，要求公司按月支付工资。同时，公司还可能面临劳动行政部门的处罚，包括责令支付工资、加付赔偿金等。
额外建议：
- 签订书面协议：如果公司确实需要按年支付工资，建议与员工签订书面协议，明确工资支付方式、时间、金额等关键条款，以避免后续纠纷。
- 保障员工权益：公司在按年支付工资时，应确保员工的基本生活需求得到满足，避免因为工资支付方式不当而影响员工的生活。
- 及时沟通解释：如果公司决定改变工资支付方式，应及时与员工沟通解释，说明原因和考虑，争取员工的理解和支持。
总结：公司按年发工资是否合法，关键在于是否与员工协商一致，并且不违反法律法规的强制性规定。如果公司有这方面的需求，建议咨询专业律师，确保合法合规。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，可以直接向我咨询。