年底发工资在大多数情况下是不合法的。根据《工资支付暂行规定》及相关法律法规，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，这是保障劳动者基本生活和经济需求的重要措施。
具体来说：
- 一般规定：用人单位应当按照约定的时间和方式支付劳动者工资，通常应为每月支付。如果用人单位没有合法理由，单纯将工资支付周期设定为年底结算，这是违反法律法规的，构成拖欠工资行为。
- 特殊情况：尽管按月支付工资是原则，但也存在一些特殊情况下年底结算工资的合法性。例如，如果用人单位与劳动者协商一致，并以书面形式明确约定工资支付周期为一年，且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么在约定的条件下年底结算工资是合法的。但这需要严格的条件和程序，且必须确保劳动者的合法权益不受损害。
如果用人单位未按时支付工资或存在拖欠工资的情况，劳动者有权采取以下措施维护自己的权益：
- 与公司协商：首先尝试与用人单位进行沟通，了解其不按时支付工资的具体原因，并要求其按照正常的工资支付周期支付工资。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，由其对用人单位的违法行为进行调查和处理。
- 申请劳动仲裁：劳动者还可以选择申请劳动仲裁，通过法律途径解决工资纠纷。在劳动仲裁过程中，劳动者需要提供充分的证据来证明用人单位的拖欠工资行为，并有可能获得相应的经济补偿。
总之，年底发工资是否合法，主要取决于用人单位是否按照合同约定和法律法规的要求进行支付。在大多数情况下，年底一次性发放工资是不符合法律规定的，劳动者应及时采取措施维护自己的合法权益。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我提问。