公司主体变更后，“N+1”赔偿的计算方式主要取决于变更的性质以及劳动合同的履行情况，具体如下：
公司合并或分立导致的主体变更
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十四条，用人单位发生合并或者分立等情况，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行。
- 在这种情况下，如果公司主体变更并未导致劳动合同无法继续履行（如工作地点、岗位、薪资等未发生不利变更），则员工通常无权要求“N+1”赔偿。
- 如果公司主体变更后，新公司拒绝履行原劳动合同，或者劳动合同因变更而无法继续履行（如工作地点发生重大变化、岗位被撤销等），且双方无法就变更劳动合同内容达成协议，那么员工可以依据《劳动合同法》第四十条和第四十六条，要求公司支付经济补偿，即“N”部分（按工作年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付）。而“+1”部分（代通知金）则通常适用于公司依据《劳动合同法》第四十条解除劳动合同且未提前三十日以书面形式通知劳动者的情况。
公司转让（包括股权转让或资产转让）导致的主体变更
- 如果公司转让导致劳动合同的用人单位主体发生变化，但新用人单位同意继续履行原劳动合同，且劳动合同内容未发生不利变更，则员工同样无权要求“N+1”赔偿。
- 如果新用人单位拒绝履行原劳动合同，或者劳动合同因转让而无法继续履行，且双方无法就变更劳动合同内容达成协议，员工可以要求支付经济补偿。此时，“N”的计算方式同上，而“+1”的适用情况也取决于是否满足《劳动合同法》第四十条规定的条件。
特殊情况下的“N+1”赔偿
- 在某些情况下，即使公司主体变更并未直接导致劳动合同无法继续履行，但如果新公司采取了不利于员工的措施（如降薪、调岗等），且员工因此选择解除劳动合同，员工可能有权要求支付经济补偿。此时，“N”的计算依据仍然是工作年限和月工资标准，而“+1”则取决于是否满足代通知金的支付条件。
- 另外，如果公司主体变更过程中存在违法行为（如未依法支付经济补偿、未依法办理社会保险转移等），员工还有权要求公司承担相应的法律责任。