当过期食品被市场监督管理部门查到后，会根据相关法律法规对涉事主体进行一系列处罚。以下是对这一问题的详细解答：
一、主要法律依据
- 《中华人民共和国食品安全法》：这是处理过期食品问题的主要法律依据。该法明确规定，生产经营标注虚假生产日期、保质期或者超过保质期的食品、食品添加剂，将面临严厉的处罚。
- 《中华人民共和国产品质量法》：该法也对销售失效、变质产品的行为有相应的处罚规定，为市场监督管理部门提供了法律支持。
二、具体处罚措施
没收违法所得和违法物品：
- 市场监督管理部门会没收涉事主体因销售过期食品而获得的违法所得。
- 同时，会没收用于违法生产经营的工具、设备、原料等物品，以及尚未销售的过期食品，以防止其继续流入市场。
罚款：
- 根据《食品安全法》的规定，罚款的金额与货值金额紧密相关。货值金额不足一万元的，将处以五万元以上十万元以下的罚款；货值金额一万元以上的，则处以货值金额十倍以上二十倍以下的罚款。
- 罚款的具体数额由市场监督管理部门根据违法行为的性质、情节和社会危害程度等因素综合确定，确保处罚的公正性和合理性。
吊销许可证：
- 对于情节严重的违法行为，如多次销售过期食品、造成严重后果等，市场监督管理部门有权吊销涉事主体的营业执照或食品经营许可证等相关证件。
- 这意味着涉事主体将失去继续从事食品生产经营活动的资格，对其经营产生重大影响。
其他法律责任：
- 如果过期食品导致消费者人身、财产或其他合法权益受到损害，涉事主体还需承担相应的民事赔偿责任，以弥补消费者的损失。
- 若构成犯罪，如生产、销售不符合安全标准的食品罪等，涉事主体还将面临刑事责任的追究，可能面临有期徒刑、罚金等严厉处罚。
三、处罚流程
- 立案调查：市场监督管理部门在接到举报或发现违法行为后，会立即进行立案调查，收集证据，查明事实真相。
- 告知听证权利：在作出行政处罚决定前，市场监督管理部门会告知当事人拟作出的行政处罚内容及事实、理由、依据，并告知当事人依法享有的陈述、申辩、要求听证等权利，确保当事人的合法权益得到保障。
- 作出处罚决定：根据调查结果和相关法律法规，市场监督管理部门会作出行政处罚决定，并送达当事人，明确处罚的内容和期限。
- 执行处罚决定：当事人应在规定期限内履行处罚决定，如缴纳罚款、没收违法所得和违法物品等。逾期不履行的，市场监督管理部门可以采取加处罚款、申请人民法院强制执行等措施，确保处罚决定得到有效执行。
四、商家应对建议
- 积极配合调查：商家应积极配合市场监督管理部门的调查工作，如实陈述事实，提供所需的所有文件、记录和资料。
- 及时整改与销毁处理：一旦发现有过期食品，商家应立即停止销售，下架并进行无害化处理或销毁，同时做好相关记录以备查验。
- 主动消除影响与召回产品：如果过期食品已经售出，商家应主动联系消费者，告知情况，并召回产品，承担相应责任，以减少消费者权益受损。
- 加强内部管理与完善制度：商家应完善食品安全管理制度，加强对员工的培训和教育，确保从采购、储存到销售的每一个环节都符合法律法规要求，预防类似问题的再次发生。
综上所述，当过期食品被市场监督管理部门查到后，涉事主体将面临严厉的处罚。因此，商家应严格遵守相关法律法规，加强内部管理，确保食品安全，以维护自身信誉和消费者权益。