结论：劳动合同中约定的底薪与实际发放工资的底薪不一致，在未经合法协商或缺乏合理依据的情况下是不合法的。您有权要求用人单位按照劳动合同约定的底薪支付工资，并可通过法律途径维护自己的权益。

详细分析：

1. 法律依据与基本原则：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，且应当采用书面形式。这意味着，任何对劳动合同内容的变更，包括底薪的调整，都必须经过双方的协商一致并以书面形式确认。
   • 同时，劳动合同中约定的劳动报酬应当明确且与实际发放的工资相符。用人单位不得通过擅自降低底薪来逃避法律规定的责任，如缴纳社会保险费、计算加班费等。

2. 未经协商一致的底薪调整不合法：

   • 如果用人单位未与您协商，擅自降低劳动合同中约定的底薪，这种行为违反了劳动合同的约定以及法律规定。您有权要求用人单位按照劳动合同约定的底薪支付工资，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护自己的权益。
   • 举例：假设您与用人单位在劳动合同中明确约定底薪为5000元/月，但用人单位未经您同意，擅自将底薪降低至4000元/月。这种情况下，用人单位的行为是不合法的，您有权要求用人单位按照5000元/月的标准支付工资。

3. 存在合理情形的底薪调整可能合法：

   • 绩效考核等正当调整：若劳动合同中明确约定底薪会根据工作表现、绩效考核结果等进行适当调整，并且用人单位有合法、合理、透明的绩效考核制度，按照该制度考核后对底薪进行调整，且调整幅度在合理范围内，这种调整可能是合法的。
   • 因客观情况发生重大变化：当出现不可抗力、企业经营困难、产业结构调整等客观情况导致原劳动合同无法继续履行时，用人单位可与您协商变更底薪。若双方达成一致并以书面形式变更劳动合同，则这种底薪的变化也是合法的。

4. 实际操作的注意事项：

   • 您应保留相关证据，如工资条、银行转账记录、劳动合同等，以证明用人单位实际发放的工资与劳动合同中约定的工资是否一致。一旦发生纠纷，这些证据将对您的维权起到关键作用。
   • 用人单位在支付工资时，必须遵守最低工资标准的规定。根据《劳动合同法》第二十条，您在试用期的工资也不得低于本单位相同岗位最低档工资或劳动合同约定工资的百分之八十，且不得低于用人单位所在地的最低工资标准。

建议：

• 如果您发现用人单位实际发放的底薪与劳动合同中约定的底薪不一致，首先尝试与用人单位沟通协商，寻求和解。
• 如果协商无果，您可以向劳动争议仲裁机构申请仲裁，对仲裁结果不满的，还可向人民法院提起诉讼。在此过程中，您需提供充分证据支持自己的主张。
• 同时，您也可以咨询我，我会根据您的具体情况，为您提供更详细的法律建议和帮助。

总结：劳动合同的底薪与实际发放工资的底薪必须保持一致，任何未经合法协商或缺乏合理依据的不一致都是不合法的。您应了解自己的权益，并在必要时通过法律途径维护自己的合法权益。同时，用人单位也应遵守相关法律法规，确保劳动合同的合法性和有效性。