结论：电动汽车充电时发生自燃，保险公司是否赔偿需根据具体保险条款、事故原因及责任认定综合判断，以下分情况说明：

1. 若投保了车损险，且自燃属于保险责任范围

根据《中国保险行业协会机动车商业保险示范条款（2020版）》，车损险的保险责任包括“火灾、爆炸”等意外事故造成的车辆损失。若充电自燃被认定为“火灾”或“自燃”（需满足保险条款对“自燃”的定义，通常指因车辆自身原因起火），且无免责情形（如车辆未按规定年检、驾驶人故意行为等），保险公司应赔偿车辆损失。
关键点：需证明自燃与充电行为无直接因果关系（如电池本身存在缺陷），或充电设备故障导致火灾，否则可能涉及责任划分问题。

2. 若投保了第三者责任险，且自燃导致他人损失

若自燃引发火灾蔓延至周边车辆、房屋或造成人员伤亡，第三者责任险可赔偿对第三方造成的财产损失或人身伤害。但需注意：

• 保险条款通常约定“被保险机动车本车所载货物、车上人员的人身伤亡”属于免责范围；
  
• 若第三方损失由充电设备故障导致（如充电桩质量问题），可能需由充电设备运营商或生产商承担责任，此时需通过侵权诉讼主张赔偿。

3. 若存在免责情形，保险公司可能拒赔

以下情形通常属于免责范围，保险公司有权拒绝赔偿：

• 车辆未年检或未通过年检：若自燃与车辆技术状况不良有关（如线路老化），且车辆未按规定年检，保险公司可能拒赔；
  
• 驾驶人故意行为：如人为纵火、违规改装电路导致自燃；
  
• 战争、暴乱等不可抗力：此类情形通常被明确排除在保险责任外；
  
• 充电设备非原厂或违规安装：若自燃由非原厂充电设备或违规改装电路引发，保险公司可能主张免责。

4. 特殊情形：电池质量问题或召回

若自燃由电池本身缺陷导致，且车辆处于召回范围内，车主可优先向生产商主张赔偿（根据《产品质量法》第41条，生产者需承担产品缺陷责任）。此时，保险公司赔偿后可能向生产商追偿（代位求偿权）。

建议行动步骤

1. 立即报案：保留现场照片、视频，联系消防部门出具火灾事故认定书，明确起火原因；
   
2. 联系保险公司：提交保险单、行驶证、事故认定书等材料，要求定损赔偿；
   
3. 核查免责条款：仔细阅读保险合同，确认是否存在拒赔情形；
   
4. 咨询专业律师：若保险公司拒赔或责任认定存在争议，可委托律师分析证据、主张权益。
   

提示：电动汽车自燃案件常涉及技术鉴定（如电池故障分析），建议尽早固定证据，避免因证据灭失影响赔偿。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。