虚开发票是违法的，员工知情后的处理方式需分情况讨论：

1. 虚开发票的违法性
   根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条及《中华人民共和国发票管理办法》相关规定，虚开发票（包括为他人虚开、为自己虚开、让他人为自己虚开、介绍他人虚开）属于违法行为，情节严重的可能构成虚开发票罪或虚开增值税专用发票罪。即使未达到刑事立案标准，税务机关也可依据《税收征收管理法》对行为人处以行政处罚（如罚款、没收违法所得等）。因此，虚开发票无论金额大小，均存在法律风险。

2. 员工知情后的处理原则
   员工发现公司存在虚开发票行为时，需根据自身参与程度、公司要求及法律后果综合判断应对方式：

   • 若员工未参与虚开行为：
     建议员工明确拒绝参与，并留存书面或电子证据（如邮件、聊天记录）证明自身未参与。若公司强制要求，可向税务机关匿名举报（拨打12366纳税服务热线或通过税务官网举报平台），以规避法律风险。
     
   • 若员工被迫参与虚开行为：
     需立即停止参与，并收集证据（如虚开发票的复印件、公司要求虚开的指令记录等）。根据《刑法》第二十八条，被胁迫参加犯罪的，可依法减轻或免除处罚，但需主动向公安机关说明情况并配合调查。
     
   • 若员工主动参与虚开行为：
     需承担相应法律责任，但若能主动投案并退还违法所得，可依据《刑法》第六十七条争取从轻或减轻处罚。此时建议尽快委托律师介入，制定辩护策略。

3. 员工需注意的法律风险

   • 刑事责任：若员工被认定为虚开发票罪的共犯（如直接实施虚开行为、提供帮助或教唆），可能面临二年以下有期徒刑、拘役或管制，并处罚金；情节特别严重的，可能面临二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
     
   • 行政责任：即使未构成犯罪，税务机关也可对员工处以罚款（如《发票管理办法》第三十七条规定的“处1万元以上5万元以下的罚款；情节严重的，处5万元以上50万元以下的罚款”）。
     
   • 职业风险：虚开发票行为可能被记入个人征信记录，影响未来就业或贷款。

建议：若您或您所在公司涉及虚开发票问题，请立即停止相关行为，并整理相关证据（如合同、发票、资金流水等）。您可直接向我咨询具体应对方案，我将结合证据情况为您分析法律风险及合规路径。