核心结论：员工虚开普通发票，法人不知情的情况下，法人仍可能面临一定法律风险，但可通过积极应对措施降低不利影响，具体需分情况讨论。

1. 法人可能面临的法律风险
   根据《刑法》第二百零五条之一及《发票管理办法》相关规定，虚开发票行为（包括为他人虚开、为自己虚开、让他人为自己虚开、介绍他人虚开）可能构成犯罪，即使法人不知情，若员工行为被认定为“单位犯罪”，法人作为直接负责的主管人员或其他直接责任人员，仍可能被追究刑事责任。但若法人能证明已尽到管理义务（如建立合规制度、定期审计等），且对虚开行为完全不知情，可主张不构成共同犯罪或单位犯罪，从而免除或减轻责任。

2. 法人不知情的举证责任
   法人需承担“不知情”的举证责任，需提供证据证明：

   • 公司已建立完善的发票管理制度（如审批流程、财务核对机制）；
     
   • 虚开行为系员工个人行为，未利用公司名义或资源；
     
   • 发现后及时采取补救措施（如主动向税务机关报告、配合调查、补缴税款等）。
     若证据充分，可降低法人被追责的风险。

3. 应对措施建议

   • 立即自查：全面梳理公司发票开具、入账情况，确认是否存在其他虚开行为；
     
   • 主动报告：向税务机关说明情况，配合调查，争取从轻处理；
     
   • 内部追责：对涉事员工依法解除劳动合同，并追究其民事赔偿责任；
     
   • 完善合规：修订财务制度，加强发票管理培训，避免类似风险。

4. 特殊情形：员工个人行为
   若员工虚开发票未利用公司名义（如私刻公章、伪造合同），且公司财务系统未记录相关交易，法人可主张该行为系员工个人犯罪，与公司无关。但需注意，若员工行为导致公司被行政处罚（如罚款、停业整顿），法人仍需作为法定代表人承担相应责任。

总结：法人不知情不构成绝对免责事由，但通过积极举证和合规整改，可显著降低法律风险。建议尽快委托律师介入，制定具体应对方案。如有进一步疑问，可直接向我咨询。