结论前置：员工没有按照制度上下班打卡，是否不算出勤需分情况讨论，不能一概而论。具体来说，若公司制度明确规定未打卡且无补卡流程即视为缺勤，且该制度合法有效，则可能不算出勤；但若员工能提供有效证据证明实际出勤，或公司制度存在不合理之处，则不应直接认定为缺勤。
一、公司制度明确规定的情况
制度合法性：
- 首先，公司的考勤制度必须合法有效，即经过民主程序制定、公示或告知劳动者，且内容不违反法律法规的强制性规定。若制度合法，则对员工具有约束力。
未打卡与缺勤的关联：
- 若公司制度明确规定“未打卡且无补卡流程即视为缺勤”，并且该规定在制度中得到了清晰、明确的表述，那么在没有其他证据证明员工实际出勤的情况下，公司有权按照制度规定将未打卡视为缺勤。
补卡流程的重要性：
- 合理的补卡流程是避免此类纠纷的关键。公司应设立便捷的补卡机制，如允许员工在忘记打卡后一定时间内提交书面说明或线上申请，并附上相关证据（如工作成果、同事证言等），以证明其实际出勤。
二、员工能提供有效证据证明实际出勤的情况
证据种类：
- 员工可以通过多种方式证明自己实际上班了，包括但不限于同事证言、工作成果、监控视频、门禁系统记录等。这些证据应能形成完整的证据链，证明员工在规定的工作时间内确实在工作场所从事与工作相关的活动。
证据效力：
- 在劳动争议中，证据的效力至关重要。若员工提供的证据真实、合法、有效，且能够证明其实际出勤，则公司不应仅凭未打卡记录就克扣工资或给予纪律处分。
三、公司制度存在不合理之处的情况
制度合理性审查：
- 若公司的考勤制度存在不合理之处，如未打卡即直接视为缺勤且无补救措施，或补卡流程过于繁琐导致员工无法及时完成等，则该制度可能因违反公平、合理原则而被认定为无效或部分无效。
法律后果：
- 在这种情况下，若员工因制度不合理而被误认为缺勤，公司应承担相应的法律责任。员工有权要求公司纠正错误、补发工资或给予其他合理补偿。
四、法律建议
对公司的建议：
- 公司应建立完善、合理的考勤制度，明确未打卡的处理流程，并设立便捷的补卡机制。同时，公司应加强对员工的培训和教育，提高员工对考勤制度的认识和遵守意识。
对员工的建议：
- 员工应严格遵守公司的考勤制度，按时打卡上下班。若因特殊原因忘记打卡，应及时按照公司规定的补卡流程进行补救，并保留好相关证据以备不时之需。若与公司因考勤问题发生纠纷，应积极与公司沟通协商，必要时可寻求法律援助或提起劳动争议仲裁/诉讼。
进一步思考：在实际操作中，考勤制度的执行往往涉及公司管理权与员工权益的平衡。因此，公司在制定和执行考勤制度时，应充分考虑员工的实际情况和合理需求，避免过度严格或一刀切的做法。同时，员工也应增强法律意识和自我保护意识，积极维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。