面对交通肇事罪中对方保险公司起诉你、你的保险公司及运输公司的情况，你可以按照以下步骤处理：

1. 明确诉讼主体与诉求：

   • 首先，需要弄清楚对方保险公司起诉的具体诉求是什么，是要求赔偿损失、确认保险责任还是其他。这通常会在起诉状中明确列出。
   • 同时，确认你、你的保险公司以及运输公司在诉讼中的地位，是作为共同被告还是其他角色。这有助于你理解自己在诉讼中的责任和义务。

2. 收集证据与材料：

   • 收集与交通事故相关的所有证据，包括事故现场照片、交警出具的事故责任认定书、医疗记录、车辆维修记录等。
   • 整理你的保险合同、运输公司的相关合同或协议，以及任何可能证明你无责或减轻责任的材料。

3. 分析法律责任：

   • 根据事故责任认定书，分析你在事故中的责任比例。这将直接影响你可能需要承担的赔偿责任。
   • 审查你的保险合同，了解保险公司应承担的保险责任范围。如果保险公司拒绝赔付或赔付不足，你需要准备相应的证据来支持你的主张。
   • 如果运输公司在事故中有过错或应承担一定责任，你也需要收集相关证据来证明这一点，以便在诉讼中主张运输公司分担责任。

4. 制定诉讼策略：

   • 根据收集到的证据和材料，以及法律责任的分析，制定合适的诉讼策略。这可能包括与对方保险公司协商和解、提出反诉或抗辩等。
   • 如果你认为自己在事故中无责或责任较轻，可以积极准备证据来支持你的主张，并在诉讼中提出。
   • 如果你认为保险公司或运输公司应承担一定责任，可以与他们沟通协商，或在诉讼中主张他们分担责任。

5. 寻求专业法律帮助：

   • 在处理此类复杂诉讼时，建议寻求专业律师的帮助。律师可以为你提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助你更好地维护自己的权益。
   • 你可以向我详细描述事故经过、收集到的证据以及你的诉求，我会根据你的具体情况为你提供更具体的法律建议。

6. 参与诉讼过程：

   • 按照法院的通知参与诉讼过程，包括出庭、提交证据、进行辩论等。
   • 在诉讼过程中保持冷静和理性，遵循法庭程序，尊重法官和对方当事人的权利。

额外建议：

• 在处理此类诉讼时，保持与保险公司和运输公司的良好沟通也很重要。他们可能也是你的盟友，共同面对对方保险公司的诉求。
• 不要忽视诉讼中的任何细节，因为它们都可能影响最终的判决结果。因此，务必认真对待每一个环节，确保自己的权益得到充分保障。