结论：请年假扣全勤奖是否违法，需根据具体情况判断，若公司规章制度中明确规定请年假会扣除全勤奖，且该制度经过民主程序制定并公示，同时不违反法律法规的强制性规定，则可能不违法；但若公司规章制度无此规定，或规定违反法律法规，则扣除全勤奖的行为违法。
分析说明：
公司规章制度的角度：
- 公司有权根据自身情况制定规章制度，包括关于年假和全勤奖的规定。
- 如果公司规章制度中明确规定了请年假会扣除全勤奖，并且该制度经过了民主程序制定（如职工代表大会或全体职工讨论）并进行了公示，同时不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照此制度执行，扣除全勤奖的行为可能不违法。
法律法规的角度：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和相关规定，劳动者享有休息休假的权利，年假是劳动者应享有的法定假期。
- 全勤奖通常是公司为了鼓励员工出勤而设立的一种奖励制度，其本质是一种福利或激励措施。
- 法律法规并未规定请年假必须扣除全勤奖，因此，如果公司规章制度中无此规定，或规定违反了法律法规的强制性规定（如侵犯了劳动者的合法权益），则扣除全勤奖的行为违法。
法律建议：
对于劳动者：
- 首先，应仔细查阅公司的规章制度，了解关于年假和全勤奖的具体规定。
- 如果认为公司扣除全勤奖的行为违法，可以与公司进行协商，要求公司恢复全勤奖或给予合理补偿。
- 如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
对于公司：
- 在制定规章制度时，应确保规章制度的内容合法合规，不侵犯劳动者的合法权益。
- 如果确实需要规定请年假扣除全勤奖，应确保该制度经过民主程序制定并进行了公示，同时考虑给予劳动者一定的补偿或替代性福利，以平衡公司和劳动者的利益。
后续行动参考：
- 劳动者在遇到此类问题时，应保留好相关证据（如公司规章制度、工资条、请假记录等），以便在需要时维护自己的权益。
- 公司也应定期审查和更新自己的规章制度，确保其符合法律法规的要求，避免因规章制度违法而引发的劳动纠纷。
如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。