关于电子档的离职证明是否有效的问题，这主要取决于该电子档离职证明是否满足法律对于证据“真实性、合法性、关联性”的要求。
首先，从法律层面来看，《劳动合同法》并未明确规定离职证明必须为纸质形式，而是强调了劳动者与用人单位之间解除劳动合同的事实。同时，《最高人民法院关于适用<中华人民共和国民事诉讼法>的解释》已经明确将微信记录、电子邮件等电子数据纳入证据范畴。这意味着，只要电子档离职证明能够真实反映劳动者与用人单位之间解除劳动合同的情况，且其来源合法、与案件事实相关联，那么它就可以作为有效的离职证明。
然而，在实际操作中，电子档离职证明的有效性可能会受到一些挑战。由于电子数据的易删改性，其真实性可能会受到质疑。为了确保电子档离职证明的有效性，用人单位和劳动者可以采取以下措施：
确保电子档离职证明的完整性：离职证明应包含劳动者的基本信息、离职原因、离职时间等关键要素，且这些信息应完整无缺。
进行公证或第三方认证：为了增强电子档离职证明的可信度，可以对其进行公证或由第三方机构进行认证。这样可以在一定程度上证明该电子档离职证明的真实性和合法性。
结合其他证据进行补强：除了电子档离职证明外，用人单位和劳动者还可以提供其他相关证据，如工作交接单、工资结算单等，以进一步证明离职事实的真实性。
注意保存和备份：用人单位和劳动者应妥善保存电子档离职证明，并备份至安全可靠的存储介质中，以防数据丢失或损坏。
至于您提到的在微信上提离职但未收到领导回复的情况，虽然这可能对离职证明的即时确认造成一定影响，但并不影响电子档离职证明本身的法律效力。只要您能够提供充分的证据证明您已经通过微信向领导提出了离职申请，并且该申请已经送达领导（例如，通过微信聊天记录、发送时间等证据），那么您的离职申请就是有效的。
综上所述，电子档的离职证明在满足法律对于证据“真实性、合法性、关联性”要求的前提下是有效的。为了确保其有效性，建议您采取上述措施进行补强和保存。