在纪委调查过程中，如果被调查人拒不承认相关事实，可能会面临以下几种后果：
调查难度增加，但不影响事实认定：
- 纪委的调查是基于多方面的证据和线索进行的，包括但不限于书面材料、证人证言、电子数据等。即使被调查人拒不承认，纪委仍可以通过其他证据来认定事实。
- 拒不承认可能会使调查过程变得更为复杂和耗时，因为纪委需要投入更多资源来收集和分析其他证据，但这并不意味着无法认定事实。
可能面临更严厉的纪律处分：
- 如果被调查人确实存在违纪违法行为，且拒不承认，这可能会被视为态度恶劣、不配合调查，从而在纪律处分上予以从重考虑。
- 纪律处分可能包括警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等，具体取决于违纪违法的性质和情节。
影响个人声誉和职业发展：
- 拒不承认违纪违法行为，一旦事实被查实，不仅会对个人声誉造成严重影响，还可能对职业发展产生长期负面影响。
- 在某些情况下，这种不诚信的行为甚至可能成为未来职业晋升或岗位调整的障碍。
可能构成妨碍公务行为：
- 如果被调查人的拒不承认行为严重干扰了纪委的正常调查工作，甚至构成妨碍公务的行为，那么可能会面临更严重的法律后果。
- 根据相关法律法规，妨碍公务行为可能会受到行政处罚，甚至可能构成犯罪，需要承担刑事责任。
法律建议：
- 积极配合调查：在纪委调查过程中，被调查人应积极配合调查工作，如实陈述事实，提供相关证据和线索。这有助于纪委更快地查清事实，也有助于被调查人争取从轻或减轻处理的机会。
- 寻求法律帮助：如果被调查人对调查过程或结果有异议，或者认为自己的权益受到侵害，可以寻求专业律师的法律帮助。律师可以提供法律咨询、代理申诉或辩护等服务，帮助被调查人维护自己的合法权益。
总结来说，拒不承认纪委调查中的事实并不是明智之举。它不仅可能增加调查难度，还可能面临更严厉的纪律处分、影响个人声誉和职业发展，甚至可能构成妨碍公务行为。因此，我建议被调查人在纪委调查过程中积极配合，如实陈述事实，并在必要时寻求法律帮助。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。