国企领导在合作单位中持有暗股属于严重违规行为，可能涉及违纪、违法甚至犯罪，需根据具体情况采取不同处理措施。以下从法律、纪律、实务操作三个角度展开分析：

一、法律层面：可能构成受贿或非法经营同类营业罪

1. 受贿罪风险
   若国企领导利用职务便利为合作单位谋取利益，并以此换取暗股分红，可能被认定为“权钱交易”。根据《刑法》第385条，受贿数额达到3万元以上即构成犯罪，最高可处无期徒刑。
   关键点：需证明“职务便利”与“获取暗股”之间的因果关系，例如合作单位因领导决策获得项目，随后领导隐名入股。

2. 非法经营同类营业罪
   若国企领导在合作单位中实际参与经营（如担任董事、高管），且经营业务与国企存在竞争关系，可能触犯《刑法》第165条。此罪不要求“谋取个人利益”，只要造成国企利益损失即可立案。
   典型案例：某国企总经理暗中持股竞争对手，通过泄露国企招标信息帮助合作单位中标，最终被判刑。

二、纪律层面：违反党纪与企业规定，必受处分

1. 《中国共产党纪律处分条例》
   第94条规定，党员干部违规拥有非上市公司股份，情节较轻的给予警告或严重警告处分；情节严重的给予撤销党内职务、留党察看或开除党籍处分。
   注意：即使未实际获利，仅“持有”行为即构成违纪。

2. 国企内部规定
   多数国企禁止领导人员在外兼职或投资关联企业，违反者可能面临降级、撤职甚至解除劳动合同。例如《中央企业领导人员廉洁从业若干规定》明确要求领导人员如实报告个人有关事项，包括投资情况。

三、实务操作：如何应对与举证

1. 对举报人/受害方的建议

   • 收集证据：重点获取暗股协议、分红记录、合作单位工商信息（如隐名股东登记）、领导职务行为与合作单位获益的关联证据（如会议纪要、邮件）。
     
   • 举报途径：向国企纪委、上级国资委或监察委员会实名举报，附上证据材料。若涉及刑事犯罪，可直接向公安机关经侦部门报案。

2. 对国企的建议

   • 内部自查：通过审计合作单位财务、核查领导人员个人事项报告、约谈相关人员等方式排查风险。
     
   • 完善制度：建立领导人员投资申报与回避制度，明确禁止持有合作单位股份，并定期抽查。

3. 对涉事领导的建议

   • 主动整改：若尚未被查处，应立即退出暗股、上缴收益，并向组织说明情况，争取从轻处理。
     
   • 法律咨询：若已进入调查程序，需结合证据情况评估是否构成犯罪，避免因对抗调查加重处罚。

温馨提示：此类案件往往涉及复杂利益链，建议根据具体情节（如持股比例、获利金额、是否造成国企损失等）进一步分析风险。若有详细信息，可直接向我咨询，我会结合案例与法条为您制定应对方案。