结论：合同一式两份，第二份不应是复印件，而应是与第一份完全独立的原件。这是为了确保合同的合法性和有效性，以及保障双方当事人的合法权益。
详细解释：
合同一式两份的含义：
- “合同一式两份”意味着在合同签订之初，就按照相同的内容和格式制作两份完全独立的原件。这种做法的目的在于确保合同的双方当事人都能各自持有一份内容完全一致、具有同等法律效力的合同文本。
原件与复印件的法律效力差异：
- 证据效力：在法律程序中，原件被视为最有力的证据。复印件虽然可以作为辅助证据，但其证明力相对较弱，无法单独作为认定案件事实的依据。若一方能提供其他证据佐证复印件的真实性（如对方承认、履行记录等），法院仍会认可其效力，但这增加了举证的难度和风险。
- 可操作性风险：复印件容易因复印质量问题导致字迹模糊、内容缺失等，这不仅影响合同的可读性和可执行性，还可能引发不必要的纠纷。
合同一式两份的重要性：
- 权益保障：一式两份的原件能够确保双方在合同履行过程中，对合同条款的理解或执行产生争议时，可以依据各自持有的原件进行核对和查证，从而充分保护双方的合法权益。
- 法律证据效力：在可能的法律纠纷中，一式两份的原件可以避免因只有一份原件而导致的可能的不当操作或篡改风险，确保双方都能提供原始的、具有法律效力的合同文本作为证据。
实践建议：
- 在签订合同时，双方应确保提供的是原件而非复印件。这可以通过打印或手写两份完全相同的原件来实现，然后双方各自签字盖章，并妥善保存。
- 若因特殊原因需要使用复印件，建议双方通过补充协议明确复印件与原件具有同等效力，并保留好相关证据以证明复印件的真实性。
特殊情况说明：
- 如果合同已经签订，且一方持有的是复印件，而另一方持有的是原件，这并不影响合同的效力。但持有复印件的一方在可能发生的法律纠纷中可能面临更大的举证风险。因此，建议持有复印件的一方尽快与对方协商，获取原件或通过其他方式增强复印件的证明力。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为有效的条件包括行为人具有相应民事行为能力、意思表示真实、不违反法律行政法规的强制性规定及公序良俗。只要合同满足这些条件且双方签字盖章，无论持有的是原件还是复印件（在有其他证据佐证的情况下），均具备法律效力。但原件的证明力通常高于复印件。
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