追缴违纪所得一般不可以直接扣工资，但需根据具体情况和公司规章制度来综合判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律原则与规定
工资支付原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位应当按时足额支付。
- 工资支付具有强制性，用人单位不得随意克扣或拖欠。
违纪所得处理：
- 违纪所得通常指的是劳动者因违反公司规章制度或法律法规而获得的非法或不当利益。
- 对于违纪所得，公司应当通过合法途径进行追缴，如要求劳动者返还、通过法律程序追讨等，而不是直接扣工资。
二、公司规章制度与劳动合同
规章制度合法性：
- 公司规章制度中如果明确规定了对于违纪所得的处理方式，包括是否可以扣工资，且该规章制度经过民主程序制定、公示并告知劳动者，那么该规定可能具有一定的法律效力。
- 但即便如此，规章制度中的规定也不能违反法律法规的强制性规定，如不得随意克扣工资。
劳动合同约定：
- 劳动合同中如果约定了对于违纪所得的处理方式，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么双方应当按照劳动合同的约定执行。
- 然而，劳动合同中的约定也不能成为公司随意克扣工资的依据。
三、实际操作与建议
合法追缴方式：
- 公司应当通过合法途径追缴违纪所得，如与劳动者协商返还、通过法律程序追讨等。
- 如果劳动者拒绝返还或无法联系到劳动者，公司可以考虑通过法律途径解决，如提起民事诉讼等。
避免直接扣工资：
- 直接扣工资可能引发劳动争议和法律风险，因为工资是劳动者的基本生活保障，随意克扣可能违反法律法规。
- 如果公司确实需要从劳动者的工资中扣除一定金额以弥补损失或追缴违纪所得，应当确保扣除的金额合理、合法，并经过劳动者的同意或符合法律法规的规定。
咨询专业律师（此处理解为引导性表述，实际回答中不直接出现，但通过我的身份体现）：
- 在处理此类问题时，公司应当谨慎行事，并咨询专业律师的意见以确保合法合规。作为专注于工伤赔偿、社会保险领域的律师，我可以为你提供更具体的法律建议和指导。
四、特殊情况说明
- 如果劳动者的违纪行为给公司造成了重大损失，且公司能够证明该损失与劳动者的违纪行为有直接因果关系，那么公司可能在一定程度上有权要求劳动者赔偿损失。但即便如此，赔偿的方式和金额也需要经过合法程序确定，不能随意扣工资。
总结与建议：追缴违纪所得一般不可以直接扣工资。公司应当通过合法途径追缴违纪所得，并避免随意克扣劳动者的工资。如果公司确实需要从劳动者的工资中扣除一定金额以弥补损失或追缴违纪所得，应当确保扣除的金额合理、合法，并经过劳动者的同意或符合法律法规的规定。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。