结论：在当事人与政府之间的合同纠纷民事诉讼中，若超过诉讼时效，确实存在法院判决驳回原告诉讼请求的判例。但具体案件结果还需根据案件事实、证据以及法院的裁判观点综合判断。

分析说明：

1. 诉讼时效的法律意义：

   • 诉讼时效是法律规定的权利人请求法院保护其民事权利的有效期限。超过诉讼时效期间，权利人将丧失胜诉权，即法院将不再保护其民事权利。
   • 在合同纠纷中，若当事人未在诉讼时效期间内提起诉讼，且对方提出诉讼时效抗辩，法院通常会判决驳回原告诉讼请求。

2. 判例的存在性：

   • 在司法实践中，确实存在因超过诉讼时效而被法院判决驳回原告诉讼请求的判例。这些判例体现了法律对诉讼时效制度的严格适用。
   • 例如，在某些政府采购合同纠纷中，供应商因未在诉讼时效期间内提起诉讼，最终法院判决驳回了其诉讼请求。

3. 具体案件的差异性：

   • 尽管存在因超过诉讼时效而被驳回诉讼请求的判例，但每个案件的具体情况都是独特的。法院在裁判时会综合考虑案件事实、证据以及双方当事人的行为等因素。
   • 在某些特殊情况下，如政府存在过错或双方存在持续性的合同关系等，法院可能会对诉讼时效的适用进行灵活处理。

4. 法律建议：

   • 对于当事人而言，在合同纠纷中应密切关注诉讼时效问题，确保在诉讼时效期间内提起诉讼或采取其他法律措施。
   • 若已超过诉讼时效，当事人仍可尝试与对方协商解决纠纷或寻求其他非诉讼途径的救济。同时，也可以咨询专业律师，了解是否存在诉讼时效中断、中止等法定情形，以及是否有可能通过其他法律手段维护自身权益。

行动建议：

• 及时咨询：若您面临与政府之间的合同纠纷且担心诉讼时效问题，建议及时向我咨询，以便了解具体的法律风险和应对策略。
• 收集证据：在诉讼或协商过程中，务必收集并保存好相关证据，以支持您的主张并应对可能的诉讼时效抗辩。
• 灵活应对：根据案件具体情况和法院裁判观点，灵活调整诉讼策略或寻求其他非诉讼途径的救济。