合同纠纷案件在以下情况下属于超过法定诉讼时效：

1. 一般诉讼时效期间经过：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这意味着，从权利人知道或应当知道其权利受到损害以及义务人之日起，如果超过三年未提起诉讼，则可能被视为超过法定诉讼时效。例如，在买卖合同中，如果买方在收到货物后发现质量问题，但未在三年内提起诉讼要求赔偿，那么其请求可能因超过诉讼时效而得不到法院的支持。

2. 最长保护期限经过：

   • 同样根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。这是一个绝对的最长保护期限，无论权利人是否知道其权利受到损害，超过这个期限后，法院将不再提供保护。不过，如有特殊情况，人民法院可根据权利人的申请决定延长，但这种情况较为罕见且需要严格的法律程序。

3. 特殊诉讼时效期间经过：

   • 对于某些特定类型的合同纠纷，法律可能规定了不同的诉讼时效期间。例如，国际货物买卖合同和技术进出口合同的诉讼时效期间为四年（《中华人民共和国民法典》第五百九十四条）。如果在这类合同纠纷中，权利人未在四年内提起诉讼，则可能被视为超过法定诉讼时效。
   • 另外，人寿保险合同的被保险人或受益人向保险人请求给付保险金的诉讼时效期间为五年（《中华人民共和国保险法》第二十六条）。如果超过这个期限，同样可能面临超过诉讼时效的风险。

4. 诉讼时效中断后未重新计算：

   • 诉讼时效期间可以因某些法定事由而中断，如权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或申请仲裁等（《中华人民共和国民法典》第一百九十五条）。从中断时起，诉讼时效期间重新计算。但是，如果中断后权利人未在重新计算的诉讼时效期间内提起诉讼或采取其他法律措施，则可能被视为超过法定诉讼时效。

5. 诉讼时效中止后未继续计算：

   • 在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因不可抗力或其他障碍导致权利人不能行使请求权，诉讼时效可以中止（《中华人民共和国民法典》第一百九十四条）。从中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。如果权利人未在中止原因消除后及时行使请求权，且未能在剩余的诉讼时效期间内提起诉讼，则可能被视为超过法定诉讼时效。

法律建议：

• 在面临合同纠纷时，权利人应密切关注诉讼时效的问题，确保在法定期间内提起诉讼或采取其他法律措施以保护自己的权益。
• 如果对诉讼时效的计算或适用有疑问，建议及时咨询专业律师以获取准确的法律意见和帮助。作为董云峰律师，我专注于刑事辩护和合同纠纷领域，可以为你提供专业的法律咨询和辩护服务。

可能后果：

• 如果合同纠纷案件超过法定诉讼时效，权利人将丧失胜诉权，即法院将不再支持其请求。这意味着权利人可能无法通过法律途径追回损失或获得赔偿。因此，及时行使权利并关注诉讼时效的问题至关重要。