关于甲方申请将工资转入乙方账户是否合法的问题，这主要取决于甲乙双方的关系以及转账的具体背景和目的，以下分情况讨论：

1. 如果甲乙双方是雇佣关系，且乙方是甲方的员工：

   • 通常情况下，工资应当直接支付给员工本人，即乙方。如果甲方无故要求将工资转入第三方账户（除非乙方明确同意并授权，或者存在特定的合法原因，如乙方因特殊原因无法亲自接收工资等），这种做法可能涉嫌违反劳动法律法规中关于工资支付的规定。
   • 法律依据：根据《劳动法》及相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
   • 建议：在这种情况下，乙方有权拒绝甲方的要求，并可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。

2. 如果甲乙双方并非雇佣关系，而是存在其他经济往来或合作：

   • 在这种情况下，甲方申请将工资（或更准确地说是款项）转入乙方账户，可能构成一种资金流转或支付行为。这种行为的合法性将取决于双方之间的合同约定、资金流转的目的以及是否违反相关法律法规（如反洗钱法、税务法规等）。
   • 如果双方有明确的合同约定，且该约定不违反法律法规：那么甲方将款项转入乙方账户可能是合法的。
   • 如果双方没有合同约定，或者约定违反法律法规：那么这种转账行为可能涉嫌违法，如逃避税务、洗钱等。
   • 建议：在这种情况下，双方应当明确合同条款，确保资金流转的合法性和合规性。如果存在任何疑问或争议，建议咨询专业律师或相关机构以获取法律意见。

3. 特殊情况下的考虑：

   • 如果乙方是甲方的代理人或受托人，且甲方明确授权乙方接收工资或款项，那么这种转账行为可能是合法的。但即便如此，也应当确保授权的明确性和合法性，并避免滥用代理权或受托权。
   • 如果转账行为涉及第三方利益（如乙方的债权人），那么还需要考虑第三方权益的保护问题。

总结与建议：

• 在大多数情况下，如果甲乙双方是雇佣关系，甲方无故要求将工资转入乙方以外的账户可能是不合法的。
• 如果双方存在其他经济往来或合作，转账行为的合法性将取决于合同约定、资金流转目的以及是否违反相关法律法规。
• 在任何情况下，都建议双方明确合同条款、确保资金流转的合法性和合规性，并在存在疑问或争议时咨询专业律师以获取法律意见。

如有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。