针对您提出的“驾驶员驾驶公司车辆违章如何处理”的问题，这确实是一个涉及公司管理、员工职责以及法律规定的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、公司层面的处理流程
违章记录查询与确认：
- 公司应定期通过交通管理部门或相关平台（如福建省公安厅交警总队互联网交通安全服务管理平台）查询公司车辆的违章记录。
- 确认违章事实后，公司需记录违章时间、地点、违章类型及罚款金额等详细信息。
责任归属判定：
- 根据公司内部管理规定，判定违章责任归属。这通常涉及对驾驶员的驾驶行为、是否遵守交通规则以及是否存在故意或过失等行为的评估。
- 若违章行为与驾驶员的职责直接相关，且驾驶员存在过错，则驾驶员应承担相应责任。
处理措施实施：
- 根据责任归属，公司可采取相应的处理措施，如对驾驶员进行警告、罚款、扣分、停职检查或解除劳动合同等。
- 同时，公司需按照交通管理部门的要求，及时处理违章罚款，避免产生滞纳金或其他不良后果。
内部管理与改进：
- 公司应借此机会加强内部管理，完善车辆使用、驾驶员培训、违章处理等相关制度。
- 定期对驾驶员进行交通安全教育，提高驾驶员的安全意识和遵规守纪的自觉性。
二、驾驶员层面的处理建议
了解违章情况：
- 驾驶员在得知自己驾驶的公司车辆违章后，应主动向公司了解违章的具体情况，包括违章时间、地点、类型及罚款金额等。
承担相应责任：
- 若违章行为确实由驾驶员造成，驾驶员应主动承担相应责任，配合公司处理违章罚款，并接受公司的相应处理措施。
申诉与维权：
- 若驾驶员认为违章记录有误或公司处理措施不当，可向公司提出申诉，并提供相关证据支持自己的观点。
- 若申诉无果，驾驶员可依法向劳动仲裁机构或法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
三、法律层面的考量
公司职责与员工职责的界定：
- 根据相关法律法规和劳动合同约定，公司应明确驾驶员的岗位职责和工作要求。
- 若公司未能明确驾驶员的违章自查、处理违章等职责，而将责任归咎于驾驶员，可能构成不当处分。如参考信息中的案例所示，法院最终判决公司支付员工经济补偿金及工资差额。
违章处理的合法性：
- 公司在处理驾驶员违章时，应遵守相关法律法规和劳动合同约定，确保处理措施的合法性和合理性。
- 驾驶员在面对公司的不当处理时，应积极收集证据，通过法律途径维护自己的合法权益。
四、实际操作建议
- 公司：应建立健全车辆管理和驾驶员管理制度，明确驾驶员的岗位职责和工作要求，定期查询和处理违章记录，加强驾驶员的交通安全教育。
- 驾驶员：应严格遵守交通规则，安全驾驶公司车辆；在得知违章后，主动了解情况并承担相应责任；若认为公司处理不当，可依法申诉或维权。
综上所述，驾驶员驾驶公司车辆违章的处理涉及公司管理、员工职责以及法律规定等多个方面。公司应建立健全相关制度，明确责任归属；驾驶员应遵守交通规则，承担相应责任；双方均应依法行事，维护自己的合法权益。